基于TMT的最小数量的细胞的蛋白质组分析的一阶段尖端方法
Narae Park1,2, Hankyul Lee1,2, Yumi Kwon1
1Chemical & Biological Integrative Research Center, Korea Institute of Science and Technology, Seoul 02792, Republic of Korea.
ACS omega
|June 12, 2023
概括
我们开发了OnM,这是一种用于分析有限的生物样本的新型蛋白质组学方法. 这种技术最大限度地减少了样本损失,使得从50个细胞中有效量化蛋白质.
科学领域:
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 分析化学 分析化学
- 生物技术是生物技术.
背景情况:
- 液体染色学-双重质谱学 (LC-MS) 的低输入样本分析是具有挑战性的,因为在制备过程中样本损失.
- 现有的方法在生物检查等有限的生物和临床样本上扎.
研究的目的:
- 开发一种修改后的列式方法 (OnM),以尽量减少低输入蛋白质组学中的样本损失.
- 使用LC-MS,从微小的生物样本中实现高效的蛋白质组概况.
主要方法:
- 开发了OnM,将mPOP冷解与On-Column同标签标签集成在一个单一的尖端.
- 从细胞溶解到双重质量标签 (TMT) 标签的加工样本,没有样本转移.
- 对蛋白质覆盖,细胞组件和TMT标签效率进行评估的OnM性能.
主要成果:
- 在蛋白质覆盖率和标签效率方面,OnM表现出与现有方法相匹配的性能.
- 在使用每通道50个细胞的TMT9-plex中量化了301个蛋白质.
- 优化了OnM,可以从每通道的5个细胞中识别51个可量化的蛋白质.
结论:
- OnM是一种强大的低输入蛋白质组学方法,用于从有限的样本中识别和量化蛋白质组.
- 该方法广泛适用,并利用现有的实验室工具.
- OnM显著推进了宝贵的生物和临床样本的分析.


