一项基于多omics转录基因组测序数据的演示揭示了食道状细胞癌瘤瘤微环境中的二硫化异质性
Fuxing Liu1, Donglan Yuan2, Xia Liu3
1Department of Pathology, The Affiliated Taizhou People's Hospital of Nanjing Medical University, Taizhou, 225300, Jiangsu, China.
Discover oncology
|June 12, 2023
概括
确定食道状细胞癌 (ESCC) 的预后特征至关重要. 基于二硫化的风险评分,特别是涉及CD96,对预测ESCC患者的预后和指导免疫治疗有希望.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
- 免疫治疗是一种免疫疗法.
背景情况:
- 食道状细胞癌 (ESCC) 是一种致命的恶性瘤,需要更好的预后标志物.
- 识别可靠的签名对于预测患者的结果和治疗反应至关重要.
研究的目的:
- 使用与二硫化相关的基因识别ESCC的预后特征.
- 探索这些特征,瘤免疫微环境和免疫治疗反应之间的关系.
主要方法:
- 大量RNA测序和单细胞RNA测序数据的分析.
- 使用多变量考克斯回归的风险评分模型的开发.
- 评估免疫透和免疫治疗反应.
- 使用qRT-PCR,殖民地形成和流细胞测量试验进行验证.
主要成果:
- 包括CD96和SOX17在内的7个基因被确定为潜在的标记物.
- CD96和SOX17作为与免疫细胞透相关的独立预后特征.
- 一个高风险组对尼沃卢马布免疫疗法的反应较差.
- CD96的表达与ESCC细胞中的细胞亡和细胞周期调节有关.
结论:
- 基于二硫化的风险评分与ESCC预后和免疫微环境有关.
- CD96是风险得分中的关键基因,影响ESCC中的增殖和亡.
- 这项研究为ESCC的临床管理和免疫治疗策略提供了洞察力.
