评估"插入和运行"纳米流液体染色学系统,用于基于MS的临床FFPE标本的蛋白质特性鉴定
Georgia Mitsa1,2,3, Vincent R Richard2,3, Yasamin Majedi3
1Division of Experimental Medicine, McGill University, Montréal, Québec, Canada.
Expert review of proteomics
|June 13, 2023
概括
Evosep One系统为临床环境提供了强大,灵敏和高通量蛋白质组分析. 这种质谱仪平台非常适合FFPE组织样本,促进了瘤学的临床决策.
科学领域:
- 临床蛋白质组学 临床蛋白质组学
- 基于质谱的蛋白质组学.
- 癌症研究 癌症研究
背景情况:
- 瘤组织的甲固定型嵌 (FFPE) 的蛋白质组分析正在获得临床应用的引力.
- 目前用于FFPE组织的蛋白质组工作流程面临的挑战是样本准备和长时间的仪器采集时间,这阻碍了临床翻译.
研究的目的:
- 将Evosep One HPLC系统的性能与领先的商业纳米流液体染色学 (nLC) 系统进行FFPE组织蛋白质组分析.
- 评估Evosep One对高通量临床质谱学的适用性.
主要方法:
- 分析了21个生物复制品的FFPE组织消化.
- 使用了一致的列上蛋白质量 (1μg) 和数据依赖的基于采集的MS/MS方法.
- 使用类似的梯度,Evosep One和Easy-nLC 1200系统的性能进行了比较.
主要成果:
- "Evosep One"系统展示了强大而敏感的高通量样本采集能力.
- Evosep One被证明是一个有价值的平台,用于在临床环境中实施基于质谱的蛋白质组学.
结论:
- Evosep One系统非常适合临床质谱应用,特别是用于FFPE组织分析.
- 像Evosep One这样的nLC/MS平台的进步可以显著告知瘤学和其他疾病的临床决策.
