从尸体解剖中分离的DNA质量:研究了1662个样本的研究

科学领域:

• 分子生物学分子生物学
• 基因组学就是基因组学.
• 生物技术是生物技术.

背景情况:

• 存在大量的甲固定嵌 (FFPE) 组织档案,用于分子分析.
• 由于DNA损伤,形式素固定对DNA隔离构成挑战.
• 了解DNA上的固定和嵌入效应对于FFPE样本实用性至关重要.

研究的目的:

• 在甲固定和嵌后评估DNA纯度,产量和完整性.
• 为了比较固定组织的DNA质量与固定后嵌入组织的DNA质量.
• 为了确定固定时间和档案存储对DNA质量的影响.

主要方法:

• 人类的心脏,肝脏和大脑组织被固定在缓冲和非缓冲的甲中,持续时间各不相同 (6小时至2个月).
• 组织也被嵌入在石块中,并存储长达30年.
• 用光谱测量来测量DNA产量和纯度;通过hTERT基因的PCR放大来评估DNA完整性.

主要成果:

• 基因纯度总体上是令人满意的,但产量有很大的差异.
• 随着固定时间的延长,PCR放大成功率急剧下降,在2个月后降至8.3%.
• 储存长达30年的甲块也降低了DNA完整性,将PCR成功率降低到3%.

结论:

• 长时间的甲固定,特别是超过14天,显著减少DNA产量.
• 通过固定时间,DNA完整性受到损害,未缓冲的甲在6天后显示效果,缓冲的甲在28天后显示效果.
• 对FFPE组织的档案存储影响了DNA完整性,随着时间的推移,PCR放大成功的减少证明了这一点.