通过BSA-seqq对控制叶发育的候选基因的鉴定和特征分析,在中国菜中进行鉴定和特征分析
Shuo Feng1, Jianbing Wu1, Kunhao Chen2,3
1Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops (South China), Ministry of Agriculture and Rural Affairs, College of Horticulture, South China Agricultural University, Guangzhou, 510642 China.
Molecular breeding : new strategies in plant improvement
|June 14, 2023
概括
中国菜中的叶 (MLs) 是由两个主导基因引起的. 通过遗传分析发现的一个关键基因,BocNGA1,可以通过作为负调节器来调节ML的发展.
科学领域:
- 植物遗传学 植物遗传学
- 分子生物学分子生物学
- 农业科学 农业科学
背景情况:
- 叶 (MLs) 是中国菜的叶子形,起源于叶子静脉.
- 了解MLs的遗传基础对于改善作物和研究叶子发育至关重要.
研究的目的:
- 阐明控制中文 kale 的 ML 发育的遗传模型.
- 确定ML形成背后的分子机制.
主要方法:
- 从两条杂交系 (Boc52与ML和Boc55与正常叶子) 构建一个F2分离群.
- 对F1和F2世代的表型检查.
- 大量分离分析测序 (BSA-seq) 用于识别定量特征位置 (QTL).
- 使用插入/删除 (InDel) 标记进行链接分析,以缩小候选地区的范围.
- 基因表达和注释分析以确定候选基因.
主要成果:
- 两种独立遗传的主导基因控制着ML的发展.
- 一个主要的QTL,qML4.1,位于kC4染色体上.
- 确定了含有B3域的转录因子基因BocNGA1,作为一个关键的候选基因.
- 在ML基因型中的BocNGA1编码和促进器区域中发现了突变 (SNPs和InDels).
- 与正常的叶子 (NL) 基因型相比,ML基因型中的BocNGA1表达显着较低.
结论:
- 博克NGA1可能在中国菜中的叶的起源中起到负面调节作用.
- 这项研究为中国菜繁殖和理解植物叶子分化提供了基础.
