甲固定,嵌组织上的全真菌PCR:要进行还是不进行?
Rebecca Sparks1, Catriona L Halliday1, Wendy Green1
1Centre for Infectious Diseases and Microbiology Laboratory Services, New South Wales Health Pathology - Institute of Clinical Pathology and Medical Research, Westmead Hospital, Westmead, NSW, Australia.
Pathology
|June 14, 2023
概括
全真菌PCR-DNA测序试验用于在甲固定,嵌 (FFPE) 组织中进行侵入性真菌疾病诊断,当真菌元素在基因病理上可见时最有效. 这种方法提高了临床意义,降低了成本.
科学领域:
- 医学真菌学 医学真菌学
- 分子诊断学 分子诊断
- 病理学 病理学 病理学
背景情况:
- 使用全真菌PCR在甲固定,嵌 (FFPE) 组织上的侵入性真菌病 (IFD) 诊断在解释结果方面存在挑战.
- 区分真正的病原体和殖民者/污染物对于准确的IFD诊断至关重要.
研究的目的:
- 评估全真菌PCR-DNA测序试验在FFPE组织上的临床效用和成本效益.
- 基于通过组织病理学可视化的真菌元素的存在或不存在来比较PCR性能.
主要方法:
- 从2021年1月到2022年8月进行泛真菌PCR的FFPE组织样本的回顾性审计.
- 泛真菌PCR结果与组织病理学发现 (真菌元素的存在或不存在) 的比较.
- 在两组中计算每临床显著的积极结果的成本.
主要成果:
- 在18.1%的FFPE样本中通过组织病理学观察到真菌形式.
- 全真菌PCR在35.6%的基因病理学阳性样本中产生了临床显著的结果,而在3%的基因病理学阴性样本中.
- 在基因病理学上观察到真菌元素时,每项临床显著结果的成本要大大降低 (AUD 258.13),而不是在基因病理学上观察到真菌元素时 (AUD 3,105.22).
结论:
- 全真菌PCR在FFPE组织中表现出有限的临床效用,当在组织病理学上没有可见的真菌元素时.
- 使用全真菌PCR主要用于阴道病理阳性样本可以提高结果的解释,并优化实验室资源的分配.
- 在FFPE组织上针对性地使用全真菌PCR可以提高用于侵入性真菌病检测的诊断产量和成本效益.
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