高吞吐量miRNA测序和生物信息学分析在胎儿小鼠口腔发育过程中识别介质细胞增殖和亡相关的miRNA

科学领域:

• 发展生物学 发展生物学
• 分子生物学分子生物学
• 遗传学 遗传学 是一个

背景情况:

• palatogenesis,的形成,需要精确的时间空间基因表达调节.
• 微RNAs (miRNAs) 已经成为正常 palatogenesis 中的关键调节者.
• 了解miRNA调节机制对于阐明 palatal 发育过程至关重要.

研究的目的:

• 研究胎儿小鼠口腔发育过程中微RNAs (miRNAs) 的动态表达和调节作用.
• 识别关键的miRNA,目标基因和参与 palatogenesis 的信号通路.
• 在口腔形成过程中构建与介质细胞增殖和亡相关的miRNA基因网络.

主要方法:

• 在各种胚胎日 (E13.5-E15.5) 使用血素和乙 (H&E) 染色对口腔发育的形态观测.
• 高通量测序和生物信息分析,以探索胎儿口腔组织中的miRNA表达和功能.
• 使用miRWalk预测miRNA目标基因,其次是基因本体学 (GO) 和基因和基因组 (KEGG) 丰富分析的京都百科全书.
• 使用miRWalk和Cytoscape构建与介质细胞增殖和亡相关的miRNA基因网络.
• 使用定量实时PCR (RT-qPCR) 验证miRNA表达.

主要成果:

• 形态分析证实了口腔融合的关键阶段,从E13.5到E15.5.
• 在 palatal 发育过程中,发现了九个动态 miRNA 表达模式的集群.
• 丰富分析突出了针对基因的miRNAs,这些基因参与了介质酶表型调节和基因激活蛋白激酶 (MAPK) 信号通路.
• 特定的miRNA基因网络,包括mmu-miR-504-3p-Hnf1b,被确定为中酶体细胞增殖和亡的关键.
• 通过RT-qPCR验证了关键miRNAs的表达水平,这些miRNAs参与了介质细胞增殖和细胞亡.

结论:

• 这项研究提供了第一个在 palatal 发育期间动态miRNA表达特征的全面识别.
• 由特定的miRNA,基因和MAPK信号通路调节的介质细胞增殖和亡,对于胎儿小鼠的口腔发育至关重要.
• 这些发现为管理 palatogenesis 的分子机制提供了新的见解.