评论: WRKY转录因子:了解功能分歧
Hui Song1, Yunpeng Cao2, Longgang Zhao3
1Key Laboratory of National Forestry and Grassland Administration on Grassland Resources and Ecology in the Yellow River Delta, College of Grassland Science, Qingdao Agricultural University, Qingdao 266109, China; Qingdao Key Laboratory of Specialty Plant Germplasm Innovation and Utilization in Saline Soils of Coastal Beach, College of Grassland Science, Qingdao Agricultural University, Qingdao 266109, China.
WRKY转录因子 (TFs) 对植物生长和环境反应至关重要. 本次审查澄清了它们的分类和功能差异,没有发现不同WRKY TF组之间的偏好功能.
科学领域:
- 植物分子生物学 植物分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 进化生物学是进化的生物学.
背景情况:
- WRKY转录因子 (TFs) 是植物生长,发育和应激反应的重要调节者.
- 虽然WRKY TFs的起源和一般功能已知,但它们的分类功能关系和同源基因的分歧仍然不清楚.
- 阿拉比多opsis thaliana WRKY TFs (AtWRKY TFs) 已得到充分研究,为更广泛的调查提供了基础.
研究的目的:
- 审查和综合现有关于WRKY TFs的文献,从1994年到2022年.
- 探索 WRKY TF 分类与生物功能之间的关系.
- 在植物物种中调查同类WRKYTFs的功能分歧.
主要方法:
- 关于WRKY TF相关出版物的全面文献搜索.
- 在基因组和转录组层面上对234种植物物种中识别WRKYTFs.
- 对约71%的AtWRKY TFs的功能数据进行分析.
主要成果:
- 在广泛的植物物种 (共234个) 中发现了WRKY TFs.
- 已经阐明了很大一部分 (~71%) AtWRKY TFs 的生物功能.
- 观察到同类WRKYTF的功能差异的证据.
- 没有特定的WRKY TF群体表现出偏好的生物功能.
结论:
- WRKY TFs的分类功能关系需要进一步澄清.
- 同类WRKYTF之间存在功能差异,但这种差异与特定的WRKYTF组无关.
- 本综述提供了WRKY TF知识的全面概述,并突出了未来研究的领域.
更多相关视频
09:17Structure-Based Simulation and Sampling of Transcription Factor Protein Movements along DNA from Atomic-Scale Stepping to Coarse-Grained Diffusion
Published on: March 1, 2022
09:58An Optimized Protocol for Electrophoretic Mobility Shift Assay Using Infrared Fluorescent Dye-labeled Oligonucleotides
Published on: November 29, 2016
相关概念视频
General Transcription Factors
Transcription Factors
Cooperative Binding of Transcription Regulators
Co-activators and Co-repressors
Cis-regulatory Sequences
Transcriptional Regulation: Riboswitches
