鉴定甲基化面板作为检测CIN3+在hrHPV阳性自取样本中的替代分拣,来自基于人口的宫癌查计划
J de Waard1, A Bhattacharya2, M T de Boer1
1Department of Gynaecologic Oncology, Cancer Research Center Groningen, University of Groningen, University Medical Center Groningen, PO-Box 30001, 9700 RB, Groningen, The Netherlands.
Clinical epigenetics
|June 15, 2023
概括
一个新的DNA甲基化标记面板,包括ANKRD18CP,LHX8和EPB41L3,可以在自我样本中有效检测宫癌前体 (CIN3+). 这一进步为基于HPV的查计划中细胞学提供了潜在的替代品,提高了效率.
科学领域:
- 妇科瘤学 妇科瘤学
- 分子诊断学 分子诊断
- 公共卫生查 公共卫生查
背景情况:
- 荷兰宫癌查计划 (PBS) 使用高风险人乳头瘤病毒 (hrHPV) 测试与细胞学分类.
- 当前的协议要求一般医生 (GP) 访问宫样本采集在阳性hrHPV自取样本后,因为细胞学在自取样本材料上是不可行的.
- 这就需要一种替代的选方法,用于 hrHPV 阳性自我样本,以提高选效率和参与度.
研究的目的:
- 开发一种甲基化标记面板,用于检测 hrHPV阳性自我样本中的3级或更严重的宫内皮质瘤 (CIN3+).
- 建立这个小组作为荷兰PBS内的细胞学潜在的替代分拣测试.
- 为了避免 hrHPV 阳性女性进行自我抽样的额外的全科医生访问.
主要方法:
- 使用定量甲基化特定PCR (QMSP) 分析了15个宿主DNA甲基化标志物,这些标志物来自
- 接收器操作特征 (ROC) 分析确定了诊断性能 (AUC).
- 使用层次聚类和决策树建模来确定最佳标记面板组成并构建预测模型.
主要成果:
- 所有15个甲基化标志物都显示了
- 九个标记物在CIN3+检测中达到AUC≥0.7.
- 由ANKRD18CP,LHX8和EPB41L3组成的最佳小组显示AUC为0.83 (训练) 和0.84 (测试),对CIN3+敏感度为82-84%,特异性为71-74%.
结论:
- 开发的甲基化标记面板 (ANKRD18CP,LHX8,EPB41L3) 在自取样材料上表现出强大的诊断性能.
- 该小组在荷兰PBS中适用于替代HRHPV阳性女性的细胞学.
- 实施这个小组可以简化查过程,消除了额外的GP访问的需要.
