预测HER2阳性乳腺癌患者的预后,通过合并病态整片图像和临床特征,使用多个实例学习
Yifan Wang1, Lu Zhang1, Yan Li1
1School of Computer Science, Southwest Petroleum University, Chengdu 610500, China.
Mathematical biosciences and engineering : MBE
|June 16, 2023
概括
一个新的多重实例学习 (MIL) 模型整合了病理图像和临床数据,以预测HER2阳性乳腺癌的预后. 这种多式联络方法提高了风险预测的准确性,与仅仅临床数据相比.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 计算病理学计算病理学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 乳腺癌仍然是一个重大的公共卫生问题,HER2阳性亚型占侵入性病例的15-20%.
- 对于HER2阳性乳腺癌患者,仅存在有限的随访数据和诊断研究.
- 准确的预后预测对于在HER2阳性乳腺癌中指导治疗决策至关重要.
研究的目的:
- 开发和验证一种新的多重实例学习 (MIL) 融合模型,用于预测HER2阳性乳腺癌患者的预后风险.
- 整合血氧氨 (HE) 病理图像与临床特征,以提高预后准确度.
- 为了比较多式融合模型与单式融合模型的性能.
主要方法:
- 将HE病理图像细分成补丁,并使用K-means进行集群.
- 通过图表注意力网络 (GAT) 和多头注意力网络将图像补丁集成为袋子特征级别表示.
- 聚合图像特征与临床数据的融合,用于使用多个实例学习框架预测预后.
主要成果:
- 拟议的基于OS的MIL聚变模型实现了0.668的三倍平均C指数,WCH测试集的C指数为0.765,TCGA独立测试集的C指数为0.726.
- 融合模型显著区分高风险和低风险组 (P = 0.034),通过卡普兰-梅尔曲线分析单独优于临床特征 (P = 0.19).
- 与单模模型相比,MIL模型在预测HER2阳性乳腺癌预后方面表现出卓越的准确性.
结论:
- 开发的多式联接MIL融合模型通过整合病理图像和临床特征,准确预测HER2阳性乳腺癌的预后风险.
- 这种方法为分析大量未标记的病理图像提供了强大的工具,提高了预后能力.
- 这些发现突显了MIL和多式联络数据集成在改善乳腺癌个性化医疗方面的潜力.
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