血清提取协议对使用UPLC-MS/MS和FTIR光谱的新陈代谢分析的影响

科学领域:

• 分析化学 分析化学
• 生物化学 生物化学
• 医学诊断 医学诊断 医学诊断

背景情况:

• 生物流体代谢学有助于了解疾病机制,疗法和生物标志物.
• 代谢分析是复杂的,受到提取和分析方法的影响.
• 多种因素影响了代谢学输出,需要对协议进行优化.

研究的目的:

• 评估两种血清代谢组提取协议的影响.
• 为了比较使用UPLC-MS/MS和FTIR光谱的提取协议.
• 评估提取协议对患者生存的预测能力.

主要方法:

• 使用甲醇的血清代谢基因提取与甲醇/酸/水混合物相比.
• 通过超高性能液体染色学-并联质谱法 (UPLC-MS/MS) 进行代谢组分析.
• 通过富里埃变换红外光谱法 (FTIR) 进行代谢组分析.

主要成果:

• 这两种提取协议在 UPLC-MS/MS 和 FTIR 平台之间在特性和可重现性方面进行了比较.
• 虽然FTIR光谱无法识别代谢物,但有效地比较了提取协议.
• FTIR光谱学开发了与UPLC-MS/MS可比的患者存活率预测模型.

结论:

• FTIR光谱是一种快速,经济,高通量技术,可以补充UPLC-MS/MS.
• FTIR光谱学有助于优化代谢组隔离过程.
• FTIR光谱显示了识别疾病预后生物标志物的潜力.