全基因组识别和氧氨酶OXA分布特征的Acinetobacterspp. 基于一个全球数据库数据库
Jia Li1, Yang Li2, Xiaoli Cao1
1Department of Laboratory Medicine, Nanjing Drum Tower Hospital, The Affiliated Hospital of Nanjing University Medical School, Nanjing, Jiangsu, China.
基因组分析显示,blaOXA-23和blaOXA-66是Acinetobacter spp.中最常见的β-乳酸酶. 在全球范围内. Acinetobacter baumannii ST2菌株被确定为全球占主导地位的克隆.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 微生物学 微生物学
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 青杆菌物种是重要的机会性病原体.
- 贝塔-乳酸酶基因,特别是blaOXA,有助于Acinetobacter的抗菌耐药性.
- 了解blaOXA的全球分布对于对抗耐药性至关重要.
研究的目的:
- 通过基因组分析识别Acinetobacter物种.
- 调查Acinetobacter物种中blaOXA基因的全球分布和特征.
主要方法:
- 从GenBank.下载并进行质量检查的6639个Acinetobacter基因组.
- 标注基因组以识别blaOXA变种和构造的家族遗传树.
- 使用的平均核酸标识 (ANI) 用于物种重型化和BLASTN用于Acinetobacter baumannii的序列类型 (ST) 确定.
主要成果:
- 在5,893个Acinetobacter基因组中确定了282个blaOXA变异.
- blaOXA-23 (53.8%) 和blaOXA-66 (44.6%) 是最常见的,通常同时发生.
- Acinetobacter baumannii是主要的物种,ST2是全球最常见的序列类型.
结论:
- 类似OXA的卡巴酶是Acinetobacter中广泛存在的β-乳糖酶.
- 在Acinetobacter baumannii中,blaOXA-23和blaOXA-66是主要的blaOXA类型.
- 阿辛托巴克特曼尼ST2代表了全球主要传播的克隆.
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