一个微生物社区发酵超过牛奶透的元基因组水平的分析
Kevin A Walters1,2,3, Geethaanjali Mohan2,3, Kevin S Myers2,3
1Department of Bacteriology, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI, United States.
Frontiers in bioengineering and biotechnology
|June 16, 2023
概括
生物反应器中的微生物群落将乳制品废物转化为化学物质. 在Actinobacteriota和Firmicutes类中的特定基因使乳糖分解和有价值的酸生产成为可能,有助于可持续的化学合成.
科学领域:
- 微生物生物技术和合成生物学
- 环境微生物学和可持续化学
背景情况:
- 发酵微生物群落可以将乳制品副产品转化为有价值的化学物质.
- 了解微生物基因组学对于优化生物过程和开发工业应用的预测工具至关重要.
研究的目的:
- 确定负责将乳制品副产品转化为特定发酵产品的微生物群落的基因组特征.
- 建立微生物社区组成,基因组潜力和可再生化学品生产之间的联系.
主要方法:
- 一个为期282天的生物反应器实验,使用超过牛奶透剂作为原料.
- 超基因组分析用于评估微生物社区动态,并构建超基因组组装基因组 (MAGs).
- 评估乳糖利用和发酵产品合成的基因组潜力.
主要成果:
- 雅基诺细菌群的成员参与了乳糖降解 (Leloir路径,双突变) 和酸,乳酸和酸的产生.
- 菲尔米库特族的成员参与了链条延长,从各种基质 (乳糖,乙醇,乳酸) 产生黄油酸,六酸和八酸.
- 与碳水化合物利用和乳酸代谢相关的特定基因在Firmicutes中被确定为链延长中的基质利用的关键指标.
结论:
- 动菌和菌的基因组特征对于乳制品废物的生物转化为特定化学物质至关重要.
- 在Firmicutes中,碳水化合物利用,乳酸运输和相关电子转移蛋白质的基因的存在可以预测它们的生长基质用于链条延长.
- 这项研究提供了对微生物社区功能的见解,用于从乳制品行业副产品中可持续生产化学品.


