单细胞RNA-seq在动脉样硬化进展期间在内皮细胞中发现了不同的途径和基因
Min Wu1, Yijin Wu1, Shulin Tang2
1Department of Cardiovascular Surgery, Guangdong Provincial People's Hospital (Guangdong Academy of Medical Sciences), Southern Medical University, China.
Frontiers in molecular biosciences
|June 16, 2023
概括
这项研究表明,液体剪切应力和TGF-β信号通路,以及内皮细胞中的ICAM1,KLF2和VCAM1基因,对于动脉样硬化进展至关重要.
科学领域:
- 心血管生物学 心血管生物学
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 动脉样硬化 (AS) 是一种复杂的炎症性疾病,涉及多种细胞类型和分子介质.
- 了解AS的关键分子驱动因素对于开发有效治疗方法至关重要.
研究的目的:
- 通过单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 识别驱动动动动脉硬化的关键分子机制和途径.
- 研究内皮细胞通路和基因在AS进展中的作用.
主要方法:
- 对人类冠状动脉细胞进行scRNA-seq分析,以确定细胞群和差异表达基因 (DEGs).
- 基因组变异分析 (GSVA) 用于评估通路活性.
- 在ApoE-/-小鼠和TGFbR1/2 KO ApoE-/-小鼠的内皮细胞中对DEGs的比较分析.
- 蛋白与蛋白相互作用 (PPI) 网络分析以确定枢纽基因.
- 人类AS组织中枢基因的组织病理学验证.
主要成果:
- 确定了九个不同的细胞群,其中内皮细胞显示较低的液体剪切应力和TGF-β信号通路得分.
- 与对照ApoE-/-小鼠相比,来自TGFbR1/2 KO小鼠的内皮细胞显著减少了流体剪切应力和TGF-β信号分数.
- 鉴定了三个枢纽基因 (ICAM1,KLF2,VCAM1),发现它们在TGFbR1/2 KO小鼠的内皮细胞和人类AS冠状动脉中被下调.
结论:
- 流体剪切应力和TGF-β信号通路在AS进展过程中在内皮细胞中发挥着关键作用.
- 已确定的枢纽基因ICAM1,KLF2和VCAM1是AS病变发生的关键分子参与者.
- 在内皮细胞中准这些通路和基因可能为动脉样硬化提供治疗策略.
