人类和小鼠体外脂肪生成模型的单细胞转录组数据集
Jiehan Li1,2,3, Christopher Jin1, Stefan Gustafsson4
1Division of Cardiovascular Medicine, Department of Medicine, Stanford University School of Medicine, Stanford, CA, 94305, USA.
Scientific data
|June 16, 2023
概括
这项研究揭示了在小鼠和人类模型中脂肪生成 (脂肪细胞形成) 过程中明显的细胞群. 这些发现提供了关于脂肪细胞分化的细胞对细胞变异性的见解.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 细胞生物学 细胞生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 脂肪生成对脂肪组织功能至关重要,涉及到前脂肪细胞分化为脂肪细胞.
- 通常使用的模型如3T3-L1和SGBS细胞有助于研究脂肪生成调节.
- 在脂肪生成过程中转录变化的细胞对细胞的变异性尚未得到充分理解.
研究的目的:
- 通过单细胞RNA测序来研究脂肪生成期间细胞对细胞的变异性.
- 为了比较小鼠 (3T3-L1) 和人类 (SGBS) 脂肪生成模型中的转录变化.
- 为未来的比较研究建立一个基础数据集.
主要方法:
- 在脂肪生成前和期间对3T3-L1和SGBS细胞进行单细胞RNA测序 (scRNA-seq).
- 混合了老鼠和人类细胞,并进行了计算解复,以区分起源.
- 转录组数据被分析,以确定不同的细胞群.
主要成果:
- 在3T3-L1和SGBS细胞中的脂肪生成导致了三种不同的细胞群.
- 这些群体对应于前脂肪细胞,早期脂肪细胞和成熟脂肪细胞.
- 该研究成功地描述了细胞群和它们的转录状态.
结论:
- 生成的scRNA-seq数据集为研究脂肪生成提供了宝贵的资源.
- 它可以在小鼠和人类体外模型之间进行比较分析.
- 了解细胞对细胞的变异性是改进脂肪生成研究的关键.
