让人能够通过微卫星研究洋中的Stemphylium vesicarium进行种群生物学研究
Daniel W Heck1, Frank Hay1, Sarah J Pethybridge1
1Plant Pathology and Plant-Microbe Biology Section, School of Integrative Plant Science, Cornell AgriTech, Cornell University, Geneva, NY 14456.
Plant disease
|June 18, 2023
概括
纽约洋作物中的Stemphylium叶病 (SLB) 主要是由Stemphylium vesicarium引起的. 新的微卫星标记物揭示了S. vesicarium种群中的高遗传多样性,有助于疾病管理策略.
科学领域:
- 植物病理学 植物病理学
- 菌群学 菌群学 菌群学是指菌群学
- 人口遗传学 人口遗传学
背景情况:
- 由*Stemphylium vesicarium*引起的叶病 (SLB) 在纽约显著影响洋产量和质量.
- *S. vesicarium*的真菌杀菌剂耐药性使疾病管理变得复杂,突显了综合策略的必要性.
- 对S. vesicarium*注射剂来源的有限知识阻碍了有效的疾病控制.
研究的目的:
- 开发新的微卫星标记物,用于对S. vesicarium种群的基因组研究.
- 在纽约洋田中描述S. vesicarium的遗传多样性和种群结构.
- 为了解S. vesicarium*种群生物学提供基础资源,以告知疾病管理.
主要方法:
- 开发了9种多态和可复制的微卫星标记物,用于S. vesicarium.
- 将多重复合标记物分成两种PCR试验,以实现高效的基因定型.
- 在2016年和2018年使用这些标记物,从纽约洋生产地区特征54个*S. vesicarium*分离物.
主要成果:
- 在54个 *S. vesicarium* 隔离物中,确定了52种独特的多部位基因型 (MLG).
- 在2016年和2018年两种种群体中观察到高基因型和等位基因多样性.
- 发现种群内部的基因变异比年间更大,在两年间都发现了密切相关的MLG,这表明克隆种群.
结论:
- 开发的微卫星标记器是研究S. vesicarium种群遗传学的有效工具.
- 纽约的 *S. vesicarium* 种群表现出高度的遗传多样性和克隆结构.
- 这些发现为制定洋中SLB综合疾病管理策略提供了关键的见解.
