对甲状腺癌的代谢相关预后模型的构建和验证
Pengfei Li1, Dejie Zhang1, Chuntao Liao1
1Department of Thyroid and Breast Surgery, Longyan First Hospital Affiliated to Fujian Medical University, China.
American journal of otolaryngology
|June 18, 2023
概括
这项研究通过分析与代谢相关的基因开发了甲状腺癌 (TC) 的7基因预后模型. 该模型有效预测患者的生存率,并可指导TC的临床治疗决策.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 遗传学 是一个遗传学.
背景情况:
- 代谢重编程是癌症发展的标志.
- 与代谢相关的基因表达在甲状腺癌 (TC) 患者之间有所不同,预后不同.
研究的目的:
- 使用与代谢相关的基因特征构建TC的预后模型.
- 确定与TC预后相关的关键代谢相关基因.
主要方法:
- 从癌症基因组图谱 (TCGA) 获得的TC mRNA表达特征和临床数据.
- 进行了差异表达分析,并与MSigDB的代谢相关基因重叠.
- 使用考克斯回归和最小绝对收缩和选择运算符 (LASSO) 进行特征选择和模型构建.
- 使用生存曲线,时间依赖的ROC曲线和基因组丰富分析 (GSEA) 验证了该模型.
主要成果:
- 为预后模型确定了7个关键的与代谢相关的基因 (AWAT2,GGT6,ENTPD1,PAPSS2,CYP26A,ACY3,PLA2G10).
- 七基因模型表明,高风险组的生存时间明显缩短.
- 时间依赖的ROC分析显示,3年和5年生存时间的AUC值>0.70.
- 在高风险组中,GSEA表明了与酸盐和甘油三代谢相关的途径的丰富.
- 考克斯回归证实了7基因模型作为TC预后的独立预测因素.
结论:
- 开发的7基因预后模型准确预测TC患者的预后.
- 该模型可以作为指导TC临床治疗策略的宝贵工具.
