在BEH3和其他BES/BZR转录因子之间的竞争关系中对下游转录组特征的全面分析
Tomoyuki Furuya1,2, Yuki Kondo2
1College of Life Sciences, Ritsumeikan University.
Genes & genetic systems
|June 18, 2023
概括
植物转录因子BES1/BZR1同类基因3 (BEH3) 与BES1和BZR1在基因标上进行竞争. BEH3的过度表达会对基因进行上调,而BES1/BZR1突变会对基因进行下调,从而显示出具有竞争力的TF相互作用.
科学领域:
- 植物分子生物学 植物分子生物学
- 植物激素信号传递器
- 转录因子调节 转录因子调节
背景情况:
- 包括BES1和BZR1在内的BES/BZR转录因子 (TF) 家族控制着植物的发育和环境反应.
- BES1/BZR1 均3 (BEH3) 被认为是其他 BES/BZR TFs 的竞争对手.
研究的目的:
- 在转录基层研究BEH3与其他BES/BZRTF之间的竞争相互作用.
- 为了确定由这种竞争关系调节的基因.
主要方法:
- 在Beh3过度表达的植物中进行转录组分析.
- 与BES1和BZR1双增益功能突变物进行比较.
- 对差异表达基因 (DEGs) 的分析和TF结合位点的丰富.
主要成果:
- 确定了46个DEGs,在BEH3过度表达中升调,在BES1/BZR1突变中降调.
- 这些DEG被用于直接的BES1/BZR1目标.
- 包含的基因编码了氨类生物合成酶,NAC TFs和与铁相关的bHLH TFs.
结论:
- 在BEH3与其他BES/BZRTF之间存在对结合目标基因的竞争关系.
- 这种竞争影响了参与类固醇代谢和铁平衡的基因表达.


