在从河水中重新利用的环境DNA样本中检测到Echinococcus multilocularis
Kensuke Mori1, Akio Imamura2, Itsuki Hirayama1
1Graduate School of Human Development and Environment, Kobe University, Kobe, Hyogo, Japan.
PeerJ
|June 19, 2023
概括
重新利用环境DNA (eDNA) 样本可以帮助检测寄生虫 Echinococcus multilocularis. 虽然检测率很低,但这种方法为这种动物性寄生虫提供了具有成本效益的监测选择.
科学领域:
- 环境DNA (eDNA) 分析
- 寄生虫学的寄生虫学
- 分子生态学分子生态学
背景情况:
- 环境DNA (eDNA) 采样产生了许多含有非目标物种数据的样本.
- 重用存储的eDNA为病原体监测提供了一个具有成本效益的策略.
- Echinococcus multilocularis是一种寄生虫,具有显著的动物性疾病关注,范围不断扩大.
研究的目的:
- 开发和验证一套用于检测环境样本中的 Echinococcus multilocularis 线粒体 DNA 的初始探针.
- 评估使用重新使用的eDNA样本用于寄生虫监测的可行性.
主要方法:
- 对 Echinococcus multilocularis. 的新型初级探头套件的设计和测试.
- 实时PCR分析128个从日本特有地区的河流中重新利用的eDNA样本.
主要成果:
- 在128个样本中的一个样本 (0.78%) 中检测到埃奇诺科克多部位菌的DNA.
- 这项研究表明,使用重新定位的eDNA检测 Echinococcus multilocularis 的可能性.
- 观察到检测率很低,可能是由于寄生虫流行率较低.
结论:
- 重新利用的eDNA样本有可能用于 Echinococcus multilocularis 监测,特别是在新殖民地区.
- 这种方法可以显著降低寄生虫检测的成本和努力.
- 需要进行进一步的研究,以优化基于eDNA的Echinococcus multilocularis检测方法.


