鉴定异质亚型和基于线粒体功能障碍和氧化应激相关基因的质瘤预后模型
Junsheng Li1,2,3,4,5, Siyu Wang1, Xiaojing Chi6
1Department of Neurosurgery, Beijing Tiantan Hospital, Capital Medical University, Beijing, China.
Frontiers in immunology
|June 19, 2023
概括
这项研究基于氧化应激和线粒体基因确定了两种低级质瘤 (LGG) 的分子亚型,开发了一个预后模型来预测患者的结果并指导精确的LGG治疗.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 遗传学 是一个遗传学.
背景情况:
- 线粒体功能障碍和氧化压力与瘤的发展和进展有关.
- 了解低度质瘤 (LGGs) 的分子亚型对于向治疗至关重要.
研究的目的:
- 使用氧化应激相关和线粒体相关基因 (OMRGs) 探索LGG分子亚型.
- 构建一个预后模型来预测LGG患者的预后和治疗反应.
主要方法:
- 从重叠的氧化压力相关基因 (ORG) 和线粒体相关基因 (MRG) 中识别了223个OMRG.
- 利用共识聚类来定义LGG分子亚型,并确定差异表达基因 (DEG).
- 通过LASSO回归开发了一个风险评分模型,分析了免疫特征,并评估了药物敏感性.
主要成果:
- 确定了两个与OMRG相关的集群;集群1与预后不佳和较低的IDH突变频率相关.
- OMRG风险得分与免疫透和检查点表达有显著的相关性.
- 高风险得分表明对化疗剂的敏感性增加,患者预后不佳 (HR=2.665,P<0.001).
结论:
- 建立了两个分子亚型和预后模型,提供了关于线粒体功能障碍和氧化应激在LGG中的作用的见解.
- 这些发现可能有助于开发更精确的质瘤治疗策略.
