对RBD特异性抗体 CoV11 的中和幅度的分子基础

科学领域:

• 免疫学 免疫学 免疫学
• 病毒学 病毒学
• 结构生物学 结构生物学

背景情况:

• 自2019年以来,SARS-CoV-2已经发生了显著的进化,变种影响了疾病的严重程度和传播能力.
• 针对受体结合域 (RBD) 上的血管氨酸转化酶2 (ACE2) 结合部位的抗体,可以对不断演变的SARS-CoV-2变体提供保护.
• 早期的流行病抗体,通常来自V_H 3-53的生殖系基因与短CDR H3s,表现出广泛的中和能力.

研究的目的:

• 阐明SARS-CoV-2 RBD通过单克隆抗体CoV11.1的识别的分子基础.
• 了解Cov11独特的结合模式如何影响其对病毒变异的中和宽度.
• 探索V_H 3-53编码抗体在识别尖峰抗原及其中和功能的机制.

主要方法:

• 对抗RBD单克隆抗体CoV11的表征,该抗体在COVID-19大流行早期被分离出来.
• 对 CoV11 与 SARS-CoV-2 RBD 结合的分析,包括其重链和轻链生殖系序列 (V_H 3-53 和 V_K 3-20).
• 研究Cov11重链互补性决定区域3 (CDR H3) 中的氨基酸变化及其对亲和和中和的影响.

主要成果:

• CoV11使用V_H 3-53和V_K 3-20生殖系序列进行RBD结合.
• 在CoV11中发生的特定重链变化,包括对Isoleucine和Arginine的变化,以及独特的CDR H3特征,增强了RBD结合亲和力.
• CoV11中的轻链修饰位于RBD结合部位之外,这表明重链相互作用的重点作用.

结论:

• 像CoV11这样的抗体,具有特定的V_H 3-53生殖系起源和CDR H3修饰,对包括Omicron在内的SARS-CoV-2令人担忧的变体 (VOC) 保持显著的中和活性.
• 最小的序列变化,明智的轻链选择和独特的结合模式对于抗体亲和力和对SARS-CoV-2的中和宽度至关重要.
• 了解这些抗体-抗原相互作用为开发广泛保护性疫苗和治疗新冠病毒的治疗提供了洞察力.