综合性scATAC-seq和scRNA-seq分析绘制了胸膜iNKT细胞发育的地图,并确定了Cbfβ的承诺
Jie Wang1,2, Indra Adrianto1,2,3,4, Kalpana Subedi1,2
1Center for Cutaneous Biology and Immunology Research, Department of Dermatology, Henry Ford Health, Detroit, MI, USA.
Cell discovery
|June 19, 2023
概括
不变的自然杀手T (iNKT) 细胞在胸腺内分化为子集. 这项研究确定了新型转录因子Cbfβ对于iNKT细胞承诺和分化至关重要.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 发展生物学 发展生物学
- 文字转录学 (Transcriptomics) 是一个学科.
背景情况:
- 不变的自然杀手T (iNKT) 细胞是关键的免疫细胞,在甲状腺中经历终端分化.
- 调控iNKT细胞子集 (iNKT1,iNKT2,iNKT17) 的分化分子机制在很大程度上仍未定义.
研究的目的:
- 阐明指导无变天然杀手T (iNKT) 细胞子集在胸腺中分化的发育轨迹和分子程序.
- 为了确定早期iNKT细胞承诺和效应因子功能的新型调节者.
主要方法:
- 超过17000个iNKT细胞的单细胞RNA测序 (scRNA-seq).
- 通过转化酶可访问的染色体测序 (scATAC-seq) 的单细胞测定,在四个胸膜发育阶段测试了39000多个iNKT细胞.
- 条件基因删除,以评估已识别的转录因子的功能.
主要成果:
- 通过不同的分子程序,iNKT2和iNKT17谱系的承诺可能早在第0阶段 (ST0) 开始.
- 在ST0之后,iNKT1的约束似乎发生,在iNKT1和iNKT2细胞中观察到显著的异质性,与更同质的iNKT17细胞不同.
- 一种新型的转录因子Cbfβ被确定在iNKT前代体承诺期间高度表达,对于iNKT细胞的发育和分化至关重要.
结论:
- 独特的分子程序控制了iNKT细胞子集的分化,对iNKT2/iNKT17系的早期承诺.
- 在iNKT1和iNKT2子集中存在细胞异质性,而iNKT17细胞更为均.
- 转录因子Cbfβ是早期iNKT细胞承诺和效应因子表型发展的关键调节者.
