解读"甘翻译后修改图谱"的解读
Qibin Wu1, Zhenxiang Li1, Jingtao Yang1
1Key Laboratory of Sugarcane Biology and Genetic Breeding, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, National Engineering Research Center for Sugarcane, College of Agriculture, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002, China.
这项研究确定了甘中的 lysine acetylation (Kac),2-hydroxyisobutyrylation (Khib) 和 lysine lactylation (Kla),揭示了它们在植物生长和应激反应中的作用. 这些发现为甘中的蛋白质修饰提供了新的见解.
科学领域:
- 植物生物学 植物生物学
- 生物化学 生物化学
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
背景情况:
- 氨酸乙化 (Kac),2-基化 (Khib) 和氨酸乳化 (Kla) 是植物生长,发育和抗压力的关键后翻译性修饰 (PTMs).
- 在像甘这样的经济重要作物中了解这些PTM对于农业的进步至关重要.
研究的目的:
- 对甘中的全球性乙基,2-基基基和乳基基进行首次全面分析.
- 识别和描述由Kac,Khib和Kla修饰的蛋白质,并阐明它们的功能.
主要方法:
- 利用基于质谱的蛋白质组学来识别和量化整个甘蛋白质组中的Kac,Khib和Kla位点.
- 进行同质分析,将修饰部位与其他植物物种 (大米,) 进行比较.
- 在各种压力条件下对修饰蛋白进行功能注释和表达分析.
主要成果:
- 在3903,1507和139个蛋白质上分别确定了8573个Kac,4637个Khib和215个Kla位点.
- 在甘和其他植物之间的基因组上发现了保存的Kac,Khib和Kla位点.
- 揭示了修改后的蛋白质主要参与能量代谢,显着存在转录因子和因干旱,寒冷和真菌病原体压力引起的应激反应蛋白质.
结论:
- 翻译后修改 (PTM) 显著影响了甘的生长,发育和对生物和非生物压力的反应.
- 这项研究为了解甘中PTMs的分子机制提供了基础数据集和新的视角.
- 需要进一步调查,以充分阐明这些PTM在甘中的功能作用和监管网络.
更多相关视频
08:12Utilizing a Comprehensive Immunoprecipitation Enrichment System to Identify an Endogenous Post-translational Modification Profile for Target Proteins
Published on: January 8, 2018
11:25Targeting Cysteine Thiols for in Vitro Site-specific Glycosylation of Recombinant Proteins
Published on: October 4, 2017
相关概念视频
Protein Glycosylation
Glycosylation occurs in...
Protein Modifications in the RER
Broadly, these modifications can be categorized into four main categories — glycosylation, formation of disulfide bonds, assembly of protein subunits, and specific proteolytic cleavages like removal of signal...
Oligosaccharide Assembly
Multiple sugar molecules that may or may...
Covalently Linked Protein Regulators
These groups modify specific amino acids in a protein....
Proteoglycans
Protein Folding Quality Check in the RER
