在马萨诸塞州患者中东方马脑炎病毒多样性,1938-2020年

科学领域:

• 病毒学 病毒学
• 神经科学是一个神经科学.
• 进化生物学 进化生物学

背景情况:

• 东部马类脑炎病毒 (EEEV) 是一种重要的阿尔法病毒,会导致严重的脑炎.
• 埃埃维疫情正在增加,需要对其演变和宿主适应性的研究.
• 了解宿主病毒进化对于EEEV出现模式至关重要.

研究的目的:

• 为了研究EEEV在人类宿主中的进化模式.
• 从当代和历史的人类样本中测序和分析EEEV基因组.
• 为了识别静脉内病毒遗传变异和细分.

主要方法:

• 分析了来自五名患者 (2004-2020年) 和一个历史病例 (1938) 的甲固定嵌入的大脑组织.
• 在现场杂交 (ISH) 证实了EEEVRNA的存在.
• 进行了病毒RNA测序和遗传学分析.

主要成果:

• 在所有当代样本中通过ISH检测到EEEVRNA.
• 遗传学分析显示,EEEV序列按地理区域进行聚类.
• 宿主内部单核酸变体 (iSNV) 分析揭示了紧密分隔的,主要是非同义变体.

结论:

• 这项研究提供了关键的初级人类EEEV序列,包括历史隔离.
• 在离散的大脑区域之间观察到最小的遗传变化.
• 关于宿主内进化的新发现有助于理解人类的EEEV自然史.