来自在模仿癌症环境中培养的Fusobacterium nucleatum外膜囊泡的定量蛋白质组分析
Xuqiang Zhang1,2, Yuxin Wang1,2, Ruochen Fan1,3
1Key Laboratory of Biotechnology and Bioresources Utilization of the Ministry of Education, College of Life Science, Dalian Minzu University, Dalian, Liaoning, China.
Microbiology spectrum
|June 21, 2023
概括
Fusobacterium nucleatum外膜囊泡 (OMVs) 在酸性瘤环境中表现出改变的蛋白质表达,许多毒性因素和代谢途径受到影响. 这项研究为结直肠癌病原和潜在的治疗点提供了新的见解.
科学领域:
- 微生物学和分子生物学
- 癌症研究 癌症研究
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
背景情况:
- 富索细菌核是一种与结直肠癌 (CRC) 相关的格兰阴性细菌.
- 瘤微环境 (TME) 具有较弱的酸性pH值,与正常肠道不同.
- 环境pH对F. nucleatum外膜囊泡 (OMV) 蛋白质的影响及其在病原性中的作用尚不清楚.
研究的目的:
- 系统地分析环境pH对F. nucleatum外膜囊泡 (OMV) 蛋白质组的影响.
- 在模仿瘤微环境的酸性条件下识别OMV蛋白质组成的变化.
- 探索改变的OMV蛋白在结直肠癌发病过程中的潜在作用.
主要方法:
- 使用双重质量标签 (TMT) 标签和高分辨率液态染色学-双重质谱法 (LC-MS/MS) 进行定量蛋白质组分析.
- 在酸性 (pH5.5) 和中性 (pH7.0) 条件下生长的F. nucleatum中的OMV蛋白质组的比较.
- 生物信息分析包括基因本体学 (GO) 和基因和基因组 (KEGG) 基因百科全书的丰富途径.
主要成果:
- 总共有991种蛋白质被确定在OMV中,大约70%的蛋白质表达在酸性条件下发生变化.
- 与中性OMV (nOMV) 相比,306种蛋白质在酸性OMV (aOMV) 中被上调和360种蛋白质被下调.
- 在aOMVs中观察到毒性因子的升级,包括13个自传媒体 (三个同类于Fap2) 和含有MORN2域的蛋白质,在aOMVs中观察到.
- 在aOMV中检测到参与脂肪酸合成和酸盐合成途径的蛋白质的显著丰富.
结论:
- 环境pH值显著改变F.核的OMV蛋白质组,影响毒性因子表达和代谢途径.
- 在TME中的酸性条件促进了F. nucleatum OMV中潜在的毒性因子的表达,这表明它在CRC进展中发挥了作用.
- 这些发现为TME中的F. nucleatum致病机制提供了新的见解,并突出了CRC预防和治疗的潜在目标.
