基于深度学习的适应光学用于光板光显微镜
Mani Ratnam Rai1,2, Chen Li1,2, H Troy Ghashghaei2,3
1Joint Department of Biomedical Engineering, North Carolina State University and University of North Carolina at Chapel Hill, Raleigh, NC 27695, USA.
Biomedical optics express
|June 21, 2023
概括
深度学习快速纠正光板光显微镜 (LSFM) 中的光学偏差,仅使用两个图像. 这种技术显著提高了清除组织的成像质量,克服了传统自适应光学的局限性.
科学领域:
- 生物医学成像学 生物医学成像学
- 光学显微镜是一种光学显微镜.
- 计算机成像成像技术
背景情况:
- 光板光显微镜 (LSFM) 能够以细胞分辨率对清除的组织进行高速成像.
- 由于样本诱导的光学偏差,特别是深层组织成像中,LSFM的性能受到损害.
- 目前的无传感器自适应光学方法用于纠正偏差是缓慢的,需要数千张图像.
研究的目的:
- 开发一种快速准确的方法来估计和纠正LSFM中的光学偏差.
- 提高图像质量,并使清除的生物标本能够更深入地成像.
- 解决高通量显微镜中现有的自适应光学技术的局限性.
主要方法:
- 利用深度学习算法从最小的图像数据 (每个区域两张图像) 估计样本诱导的偏差.
- 基于深度学习估计,实现了可变形镜来纠正偏差.
- 引入了一种新的抽样策略,用于高效的神经网络培训.
- 对比了两个不同的深度学习网络架构用于误差估计.
主要成果:
- 深度学习准确地估计了仅来自两个图像的误差,大大缩短了获取时间.
- 使用可变形镜的偏差校正在清除的组织中明显改善了图像质量.
- 开发的方法比传统的无传感器自适应光学提供了显著的速度改进.
- 两个测试的网络架构都提供了有效的偏差校正.
结论:
- 深度学习提供了一种高效,快速的解决方案来纠正LSFM中的光学偏差.
- 这种方法提高了图像质量,并促进了清除组织的更深入,更可靠的成像.
- 该方法克服了传统自适应光学的关键速度限制,使得生物样本分析更快,更全面.
相关概念视频
Super-resolution Fluorescence Microscopy
7.1K
Super-resolution fluorescence microscopy (SRFM) provides a better resolution than conventional fluorescence microscopy by reducing the point spread function (PSF). PSF is the light intensity distribution from a point that causes it to appear blurred. Due to PSF, each fluorescing point appears bigger than its actual size, and it is the PSF interference of nearby fluorophores that causes the blurred image. Various approaches to achieving higher resolution through SRFM have recently been...
7.1K
Confocal Fluorescence Microscopy
13.4K
Confocal microscopy is an advanced microscopic technique. The prime advantage of the confocal microscope over other microscopy techniques is its ability to block the out-of-focus light from the illuminated samples using pinholes. It is widely used with fluorescence optics to obtain high-resolution, sharp contrast images. Unlike optical microscopes, confocal microscopes use a focused beam of light laser to scan the entire sample surface at different z-planes. These microscopes are, therefore,...
13.4K


