在喜马拉雅雪鱼,Schizothorax labiatus中使用LFQ技术进行基于LC-MS/MS的蛋白质的表征和差异表达
Kousar Jan1, Imtiaz Ahmed2, Nazir Ahmad Dar3
1Fish Nutrition Research Laboratory, Department of Zoology, University of Kashmir, Hazratbal, Srinagar, Jammu and Kashmir, 190 006, India.
Scientific reports
|June 22, 2023
概括
这项研究使用液态染色体质谱分析了Schizothorax labiatus的肌肉蛋白质组. 与生长和新陈代谢相关的关键蛋白质的下调,而免疫反应蛋白质的上调,表明对鱼类生理学的季节性影响.
科学领域:
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 鱼类生理学 鱼类生理学
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 鱼类肌肉蛋白质的表征对于理解生理和代谢过程至关重要.
- 冷水鱼,如雪鱼 (Schizothorax labiatus),拥有蛋白质,使其能够在波动的温度 (0-20°C) 中生存.
- 研究蛋白质组概况为生物体适应和对环境因素的反应提供了洞察力.
研究的目的:
- 用无标签量化液体染色体质谱法研究Schizothorax labiatus的肌肉蛋白质组概况.
- 为了在不同体重组中识别雄性和雌性S. labiatus之间的差异表达蛋白质.
- 为了将蛋白质表达模式与生理状态,环境条件和季节性变化相关联.
主要方法:
- 来自两个体重组的Schizothorax labiatus肌肉组织的蛋白质组分析.
- 液体染色学-质谱学 (LC-MS) 使用无标签定量.
- 使用ProteinLynx全球服务器软件进行蛋白质识别和量化.
主要成果:
- 在第一组中,确定了235种蛋白质 (男性) 和238种蛋白质 (女性),在性别之间发现了14种下调和22种上调蛋白质.
- 在第二组中,发现了227种蛋白质 (男性) 和194种蛋白质 (女性),在性别之间发现了20种下调蛋白质和18种上调蛋白质.
- 参与生长,骨肌肉发育和新陈代谢的蛋白质的下调,而与免疫反应,葡萄糖代谢和生殖有关的蛋白质的上调.
结论:
- 增长和新陈代谢蛋白的下调表明,由于食物供应和代谢活动减少,冬季的生长速度较慢.
- 免疫反应蛋白的上调表明河流生态系统中的污染和微生物负载可能较低.
- 观察到的蛋白质表达模式与季节性生殖周期,生殖腺发育和用于生存和繁殖的能量利用有关.
