对新的抗瘤二复合物的计算和实验检查:CT-DNA-/BSA结合,化预测,DFT视角,对接,分子动力学模拟和ONIOM
Ashraf Sadat Dorafshan Tabatabai1, Effat Dehghanian1, Hassan Mansouri-Torshizi1
1Department of Chemistry, University of Sistan and Baluchestan, Zahedan, Iran.
Journal of biomolecular structure & dynamics
|June 23, 2023
概括
一种新的二复合物 ([Pd(en) ((acac) ]NO3) 对白血病细胞表现出显著的细胞毒性作用,其性能优于西斯. 通过光谱和计算方法证实了它与DNA和蛋白质的相互作用,突出了它作为治疗剂的潜力.
科学领域:
- 无机化学 无机化学
- 计算化学计算化学
- 生物化学 生物化学
背景情况:
- 开发具有增强生物活性的新型金属复合物对于治疗应用至关重要.
- ((II) 复合物由于其多样化的生物特性而引起人们的兴趣.
研究的目的:
- 为了合成和表征一种新的 (II) 复合物,[Pd (en) (acac) ]NO3.
- 评估该复合体对K562白血病细胞系的细胞毒性活性.
- 研究该复合体与DNA和BSA等生物大分子的相互作用机制.
主要方法:
- (II) 复合物的合成和完整表征.
- 使用MTT试验进行细胞毒性评估.
- 在使用DFT/B3LYP和OSIRIS DataWarrior的分析中.
- 对生物分子相互作用进行光谱研究 (光,UV-Vis,粘度,凝电泳,FRET,CD).
- 计算建模包括分子对接和分子动力学模拟.
- ONIOM (QM/MM) 计算用于研究结合相互作用.
主要成果:
- 合成的[Pd(en) ((acac) ]NO3复合体对K562白血病细胞表现出显著的细胞毒性活性,超过了西斯.
- 在 silico 研究预测了有利的物理化学和毒性概况.
- 谱学和计算分析证实了该复合物与CT-DNA和BSA的相互作用,主要是通过H-bond和范德瓦尔斯力.
- 分子动力学模拟验证了复合物的结合位置的稳定性.
- ONIOM的分析表明,结合后复合物和生物分子的结构变化.
结论:
- 新型二复合物显示出作为抗癌剂的巨大潜力.
- 该研究阐明了该复合物与DNA和蛋白质的相互作用模式,为药物设计提供了洞察力.
- 结合实验和计算方法,可以全面了解该综合体的生物活动.
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