计算识别新的TKI作为潜在的非共价可逆EGFRL858R/T790M抑制剂:VHTS,分子对接,DFT研究和分子动态模拟
Dorra Abdelmalek1, Fahmi Smaoui2, Fakher Frikha1
1Laboratory of Molecular and Cellular Screening Processes, Centre of Biotechnology of Sfax, University of Sfax, Sfax, Tunisia.
Journal of biomolecular structure & dynamics
|June 23, 2023
概括
这项研究选了超过5万种由erlotinib衍生的化合物,以寻找新的非小细胞肺癌治疗方法. 最好的候选人表现出有前途的强效抗瘤药物,可能克服药物耐药性.
科学领域:
- 药用化学 医学化学
- 计算机化药物发现技术
- 在瘤学瘤学.
背景情况:
- 非小细胞肺癌 (NSCLC) 的治疗通常涉及准表皮生长因子受体 (EGFR) 氨酸激酶.
- 耐药性,特别是像EGFRL858R/T790M这样的突变,在NSCLC治疗中构成了重大挑战.
研究的目的:
- 使用高通量虚拟查 (HTVS) 框架识别新型非共价可逆EGFRL858R/T790M抑制剂.
- 评估Erlotinib衍生化合物的潜力,作为改善NSCLC的抗瘤药物候选药物.
主要方法:
- 采用了一个可扩展的HTVS框架,拥有超过5万个erlotinib衍生化合物的库.
- 使用标准精度 (SP) 和超精度 (XP) 对接,结合自由能量计算,集群分析和ADMET属性预测.
- 进行了分子动力学 (MD) 模拟和密度函数理论 (DFT) 计算,以分析蛋白质 - 连接体相互作用和构造稳定性.
主要成果:
- 与Erlotinib相比,确定了具有增强部分的最高得分分子.
- 为MD模拟选择了得分最高的分子,揭示了结构稳定性和强大的分子间相互作用.
- 证明选的化合物具有有利的药理动力学特性.
结论:
- 几乎选的化合物显示出作为NSCLC的强有力的抗瘤药物候选者的潜力.
- 这些新型抑制剂可能提供一种克服现有的药物耐药性机制的策略.
- 这些发现为进一步的治疗开发和实验验证提供了基础.
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