通过基于结构的虚拟查和分子动力学来确定潜在的食用香料作为EGFR和EGFR突变T790M/L858R抑制剂
Iqrar Ahmad Ansari1,2, Bimal Debnath3, Saikat Kar4
1Department of Pharmaceutical Chemistry, Prof. Ravindra Nikam College of Pharmacy, Gondur, Dhule, Maharashtra, India.
Journal of biomolecular structure & dynamics
|June 23, 2023
概括
这项研究选了香料中抑制表皮生长因子受体 (EGFR) 氨酸激酶的化合物,这是癌症标. 在洋,和大中发现了有前途的候选药物,显示出抗癌疗法的潜力.
科学领域:
- 计算化学的计算化学
- 药理学 药理学是指药理学的学科.
- 在瘤学瘤学.
背景情况:
- 皮表皮生长因子受体 (EGFR) 氨酸激酶在各种人类癌症中经常过度表达.
- 在开发新型抗癌疗法方面,EGFR是重要的目标.
研究的目的:
- 为了识别香料中的天然化合物,可以抑制EGFR氨酸激酶活性.
- 评估这些化合物作为抗癌药物候选物的潜力.
主要方法:
- 使用Glide.使用EGFR (PDB ID: 3W32) 对香料数据库 (1439种化合物) 的基于结构的虚拟选.
- 使用AutodockVina.使用EGFR及其突变体 (T790M/L858R) 的顶级命中分子对接.
- 通过ADME过,分子动力学 (MD) 模拟和MM-GBSA绑定能量计算来进行击中精炼.
主要成果:
- 18种化合物表现出显著的结合,其中最受欢迎的化合物表现出强烈的结合于野生型EGFR和T790M/L858R突变物.
- MD模拟证实了蛋白质 - 配体复合物的稳定性对于 CL_07,AC_11 和 AS_49.4 的命中.
- 化合物CL_07 (来自黄) 和AS_49 (来自大) 显示出有利的结合能,而AC_11 (来自洋) 与Gefitinib相似.
结论:
- 香料如 *Curcuma longa*, *Allium sativum* 和 *Allium cepa* 含有可能作为EGFR向抗癌剂的化合物.
- 化合物CL_07,AC_11和AS_49需要进一步的研究和优化治疗开发.
- 在体外验证对于确认这些已识别的香料衍生化合物的抗癌疗效至关重要.
关键词:
ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME欧洲农业基金会 (EGFR) 是一个基金.在MM-GBSA中使用.可以食用的香料.分子对接的分子对接.分子动力学分子动力学更多相关视频
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