通过2bRAD-M揭示的NMIBC和MIBC患者的膀微生物组
Jian-Xuan Sun1, Qi-Dong Xia1, Xing-Yu Zhong1
1Department and Institute of Urology, Tongji Hospital, Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan, China.
Frontiers in cellular and infection microbiology
|June 23, 2023
概括
这项研究揭示了非肌肉侵入性膀癌 (NMIBC) 和肌肉侵入性膀癌 (MIBC) 组织在膀癌微生物群中的显著差异. 这些发现表明微生物失生症可能在膀癌的发展和进展中发挥作用.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 膀癌 (BCa) 是一种常见的尿路恶性瘤,具有明显的非肌肉侵入性 (NMIBC) 和肌肉侵入性 (MIBC) 形式.
- 在NMIBC和MIBC之间微生物群的差异仍然不完全理解.
- 调查这些差异对于理解BCa病变的产生至关重要.
研究的目的:
- 为了研究NMIBC和MIBC组织的独特微生物群概况.
- 识别与每个BCa亚型相关的特定微生物物种和功能途径.
- 探索微生物失生症在BCa发展中的潜在作用.
主要方法:
- 在手术切除的NMIBC和MIBC瘤组织上利用了微生物组 (2bRAD-M) 的2bRAD测序.
- 提取的DNA和使用的IIB型限制性内核酶用于微生物基因组裂变和标签映射.
- 使用特定物种的2bRAD标记物进行定性和定量微生物分析.
主要成果:
- 检测到527种微生物,NMIBC的多样性明显高于MIBC组织.
- 确定了不同的微生物组成,其中Ralstonia_sp000620465在两者中都占主导地位.
- 在NMIBC中发现了丰富的物种 (例如,Acinetobacter_guillouiae) 和MIBC中存在过多的物种 (例如,Ralstonia_mannitolilytica).
- LEfSe分析显示了252种歧视性种群,功能分析发现了COG和信号通路的差异.
结论:
- 这是第一个比较MIBC和NMIBC组织微生物组的2bRAD-M研究.
- 显著的微生物环境差异表明,dysbiosis和BCa之间的潜在关联.
- 这些发现为未来研究BCa机制和潜在的治疗点提供了基础.
