全基因组关联识别了控制黑收获后质量的关键位置

科学领域:

• 植物遗传学 植物遗传学
• 园艺科学 园艺科学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 黑 (Rubus亚属Rubus) 是一种有价值的特种作物,由于收获后的退化,在运输过程中容易遭受重大经济损失.
• 常见的问题包括水果泄漏,腐烂,变形和变色,这些问题被集体称为红色葡萄糖回归 (RDR).
• 虽然传统的育种提高了水果坚硬度,但这些特征的遗传基础在很大程度上仍未被探索.

研究的目的:

• 进行全基因组关联研究 (GWAS),以确定控制黑果坚硬度和RDR的遗传变异.
• 了解新鲜市场黑的收获后质量特征的基因架构.
• 为未来的基因组选择模型奠定基础,旨在增强黑收获后的特征.

主要方法:

• 一项全基因组关联研究在三年 (2019-2021) 的时间内对300种四体新鲜市场黑基因型进行了基因组研究.
• 基因定型涉及65,995个单核酸多态 (SNP),主要位于R的基因区域. 阿尔古图斯 参考基因组.参考基因组.
• 对果实坚硬度和RDR的表型数据与基因型数据一起收集和分析.

主要成果:

• 果实坚硬度的遗传率为68%,而RDR的遗传率为34%.
• 聚氨酸酶 (PG),点丁甲基化酶 (PME) 和葡萄糖内分-1,3-β-葡萄糖酶的同类变异与水果坚硬性有关,解释了27%的变异.
• 染色体Ra02上的PG同类变异与RDR相关,解释了8%的变异,并且观察到RDR和水果坚硬度之间存在显著的负相关性.

结论:

• 黑的收获后质量特征是复杂的,可能受到多个定量特征位点 (QTL) 的影响,但影响很小.
• 这项研究是首次对黑的定量特征进行大规模遗传测绘,为未来的研究奠定了基础.
• 生成的表型和基因型数据可用于开发基因组选择模型,以改善黑育种计划中的收获后质量.