阿波蛋白E甲基化与肝细胞癌中的免疫微环境相关
1Department of Gastroenterology, Renmin Hospital of Wuhan University, Wuhan University, Wuhan, P.R. China.
Acta oncologica (Stockholm, Sweden)
|June 23, 2023
概括
脂蛋白E (APOE) 甲基化,而不是转录,与肝细胞癌 (HCC) 中的免疫细胞密切相关. APOE甲基化状态影响HCC的免疫激活和患者预后.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 遗传学 遗传学 是一个
背景情况:
- 肝细胞癌 (HCC) 是一个主要的全球健康问题.
- 了解瘤微环境对于开发有效的HCC疗法至关重要.
研究的目的:
- 研究阿波利波蛋白E (APOE) 转录,甲基化和HCC患者的免疫微环境之间的相关性.
- 确定APOE蛋白在HCC中的预后作用和免疫相关性.
主要方法:
- 对TCGA,GEO和ICGC数据集进行全面的生物信息分析.
- 对APOE mRNA,甲基化和蛋白质表达特征的研究.
- 基于APOE甲基化状态的HCC患者的分层.
- 免疫组织化学评估APOE蛋白与PD-1和CTLA4.4的相关性.
主要成果:
- 在HCC组织中,APOE mRNA被差异表达,APOE甲基化被下调.
- APOE甲基化与APOE转录负相关 (r=-0.52,p<0.0001).
- 与低甲基化小组相比,APOE高甲基化小组显示出更紧密的免疫相关性和不同的免疫激活状态.
- APOE转录与较弱的免疫透和激活有关.
- 过度表达的APOE蛋白与更好的生存率相关,但不是PD-1或CTLA4.
结论:
- 在HCC中,APOE甲基化与免疫细胞的相关性比APOE mRNA更强.
- 在HCC瘤微环境中,APOE甲基化可能在免疫调节中发挥重要作用.
