一个风险评分模型,基于内质网膜压力相关的基因,用于预测骨髓瘤的预后值
Yong Zhao1, Jijian Gao2, Yong Fan2
1Department of Orthopaedic Surgery, Shengzhou People's Hospital (the First Affiliated Hospital of Zhejiang University Shengzhou Branch), Shaoxing, 312400, Zhejiang, China. zhaoyong7711@163.com.
BMC musculoskeletal disorders
|June 23, 2023
概括
这项研究开发了一种新的骨质肉瘤预后预测模型,使用六个与内分泌网膜压力相关的基因. 该模型有助于识别高风险患者,并指导个性化治疗策略,以获得更好的结果.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 骨髓瘤预后预测仍然具有挑战性.
- 细胞内膜网膜压力 (ERS) 在癌症进展中起作用.
- 确定可靠的预后标志物对于患者管理至关重要.
研究的目的:
- 开发一个骨髓瘤预后预测模型.
- 确定与生存相关的关键内质网膜压力相关基因.
- 验证模型的预测准确性和临床实用性.
主要方法:
- 利用癌症基因组图谱 (TCGA) 数据库来识别骨髓瘤中差异表达基因 (DEGs).
- 集成的DEG与ERS基因的基因组丰富分析 (GSEA),以选择相关的DEG.
- 基于与生存相关的ERS DEGs构建了一个风险评分模型和一个名图.
- 使用卡普兰-梅尔曲线,接收器运行特征 (ROC) 曲线和RT-qPCR验证的模型性能.
主要成果:
- 在转移性骨肉瘤中确定了41种与ERS相关的DEG.
- 建立了一个具有强大的预测性能的六基因风险评分模型 (ATP2A3,ERMP1,FBXO6,ITPR1,NFE2L2,USP13).
- 年龄,瘤转移和风险评分是独立的预后因素,被整合到名ogram中.
- 在高风险和低风险组之间观察到免疫细胞透的显著差异.
- 通过RT-qPCR确认了生物信息学分析,一致率为83.33%.
结论:
- 开发了一个强大的骨髓瘤预测模型,基于六个预后ERS相关基因.
- 该模型和名图可以帮助分层患者并预测生存结果.
- 这种方法有可能引导骨髓瘤的个性化治疗策略.
