计算机辅助虚拟选和对Aptamer进行对接优化的最新进展
Yijie Liu1, Jie Yang1, Meilun Chen1
1Xiangya School of Pharmaceutical Sciences, Central South University, Changsha, China.
Current topics in medicinal chemistry
|June 26, 2023
概括
传统的aptamer查复杂,成功率很低. 本综述评估了计算机辅助的虚拟选工具,以提高aptamer发现和选择效率.
科学领域:
- 生物技术是生物技术.
- 计算生物学 计算生物学
- 分子诊断学 分子诊断
背景情况:
- 对蛋白质分析,基因工程和诊断至关重要,但传统的SELEX查效率低下.
- 对于 SELEX 对于胺体查的成功率是该领域的一个重大挑战.
- 计算机辅助的虚拟查提供了一个有希望的替代方案,以加速aptamer发现.
研究的目的:
- 为了评估四个主流分子对接软件程序的准确性和预测性能,用于aptamer选.
- 为了指导研究人员选择适合的计算工具,以发现aptamer.
- 提供计算机辅助虚拟查应用在aptamer查中的概述,并建议未来的研究方向.
主要方法:
- 对四个领先的分子对接软件的对接特征的审查和总结:自动对接,自动对接Vina,MOE和hex Dock.
- 评估这些软件程序的准确性和预测性能,使用实验数据进行aptamer对接.
主要成果:
- 在当前用于aptamer对接的虚拟选软件中观察到准确度和精度的变化.
- 对比分析提供了对Auto dock,Auto dock Vina,MOE和hex Dock用于aptamer应用程序的性能的见解.
结论:
- 与传统方法相比,计算机辅助的虚拟查显著加快了aptamer查.
- 精确的选择分子对接软件对于成功的体发现至关重要.
- 这一综述为计算机辅助胺检查的未来进展提供了路线图.
