尿病原性大肠杆菌菌种群结构和抗菌素敏感性 在英国诺福克,英国
Cailean Carter1,2, Alexandra Hutchison3, Steven Rudder1,2
1Microbes in the Food Chain, Quadram Institute, Norwich NR4 7UQ, UK.
The Journal of antimicrobial chemotherapy
|June 26, 2023
概括
诺福克州的尿病原性大肠杆菌 (UPEC) 呈现出越来越多的抗药性,特别是在医院. 这项研究确定了关键的耐药菌株和基因,突出了管理尿路感染的持续监测的必要性.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 传染性疾病 传染性疾病
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 尿路感染 (UTI) 是初级保健访问的常见原因.
- 泌尿病原性大肠杆菌 (UPEC) 是诺福克地区尿路感染的主要原因,呈现出越来越多的抗药性.
- 这种耐药性对有效治疗构成重大挑战.
研究的目的:
- 确定在诺福克社区和医院环境中流通的特定UPEC克隆群和抗生素耐药基因.
- 为 UPEC 在诺福克进行首次此类区域研究.
- 了解UPEC中抗菌素耐药性的传播模式.
主要方法:
- 从诺福克的尿路感染中收集了199个临床大肠杆菌分离物 (2021年8月 - 2022年1月).
- 使用Illumina和MinION平台进行全基因组测序.
- 在基多位序列类型 (MLST) 和抗生素耐药性决定性检测中进行.
主要成果:
- 确定了70种序列类型 (STs),其中8种谱系主导了UPEC群体.
- 在医院中发现6.5%的分离物具有多药耐药性 (MDR),具有较高的安培和三甲耐药性.
- 观察到MDR UPEC ST131和ST1193的可能克隆扩张,携带blaCTX-M-15,blaOXA-1和aac(6') -Ib-cr5基因.
结论:
- 诺福克州大多数尿路感染是由非MDR UPEC引起的,与国家和国际趋势保持一致.
- 对UPEC分离物及其来源的持续监测对于减少尿路感染的负担至关重要.
- 基因组监测对于跟踪和控制UPEC中的抗菌素耐药性至关重要.
