亲炎性两极分化和结直肠癌调节了人类原发性巨细胞中的替代性和内基性多化
Joana Wilton1,2,3, Filipa Lopes de Mendonça2,3, Isabel Pereira-Castro2,3
1Graduate Program in Areas of Basic and Applied Biology (GABBA) PhD Program, ICBAS-Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar, Universidade do Porto, Porto, Portugal.
Frontiers in immunology
|June 26, 2023
概括
亲炎性两极化和结直肠癌 (CRC) 细胞改变人类巨细胞中的基因表达和多化. 这些变化,包括新的mRNA异型,为CRC提供了潜在的诊断和治疗点.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 巨细胞是具有适应性炎症特征的重要免疫细胞.
- 替代多氨基化 (APA) 和内基多氨基化 (IPA) 调节基因表达,特别是在癌症和免疫细胞中.
- 巨分化和结直肠癌 (CRC) 对原发性人类巨细胞中的3'UTR-APA和IPA的影响以前尚不清楚.
研究的目的:
- 为了研究巨细胞极化和CRC细胞如何影响人类初级巨细胞中的3'UTR-APA和IPA.
- 为了识别这些过程中产生的新型mRNA异型.
- 探索SRSF12在CRC微环境中的促炎性巨细胞中的作用.
主要方法:
- 初级人体单细胞被分离,分化为促炎性巨细胞,并与CRC细胞共同培养.
- 使用ChrRNA-Seq和3'RNA-Seq量化基因表达和表征3'UTR-APA和IPAmRNA异型.
- 在M1巨细胞中进行了SRSF12淘汰,以评估其功能影响.
主要成果:
- 巨细胞的亲炎性两极分化显著增加了相关基因中的近邻3'UTR多化和IPA事件.
- 在促炎性两极化期间,在差异基因表达和IPA之间观察到负相关性.
- 与CRC细胞共同培养改变了巨细胞的炎症表型,上调了前瘤基因,并诱导了3'UTR-APA变化,其中一些反映在CRC患者瘤相关巨细胞中.
- 在巨细胞的炎症性两极分化过程中,SRSF12是最上调的mRNA前处理基因;它的敲击在全球范围内降低了基因表达的调节,特别是在免疫反应基因中.
结论:
- 新的3'UTR-APA和IPAmRNA异型在促炎性巨细胞极化和CRC共同培养过程中出现,可能作为诊断或治疗生物标志物.
- SRSF12在促炎性巨细胞中起着重要作用,影响瘤微环境中的基因表达调节和免疫反应.
