对大气环境中低生物质生物气溶的采样和新一代测序方法的观点
Jianjian Hou1, So Fujiyoshi1,2, Ishara Uhanie Perera1
1Microbial Genomics and Ecology, Center for the Planetary Health and Innovation Science (PHIS), The IDEC Institute, Hiroshima University, Hiroshima, 739-0046 Japan.
Journal of the Indian Institute of Science
|June 26, 2023
概括
这篇评论探讨了生物气溶,微小的空气中的微粒. 它强调了使用新一代测序 (NGS) 研究低生物质样本的挑战,并建议改进采样方法,以准确检测微生物.
科学领域:
- 环境科学 环境科学
- 微生物学 微生物学
- 大气科学 大气科学
背景情况:
- 生物气溶对大气过程至关重要,并影响人类健康.
- 大多数环境,包括室内和室外环境,都存在低生物质生物气溶.
- 专门的环境,如洁净室和空间站含有超低生物质生物气溶.
研究的目的:
- 审查主要的生物气溶来源和影响因素.
- 讨论空气采样和新一代测序 (NGS) 的进展,以对低生物质生物气溶进行表征.
- 为了解决NGS分析偏差对超低生物质样本的挑战.
主要方法:
- 对生物气溶采样技术的当前文献的综述.
- 分析新一代测序 (NGS) 方法用于微生物群体的表征.
- 专注于大容量空气采样器和NGS的强大的样本处理协议.
主要成果:
- 标准采样方法可能会在NGS分析中带来偏差,特别是对于超低生物质.
- 需要大量的基于过器或基于液体的采样器来提高微生物检测极限.
- 在NGS和生物信息学方面的进步使生物气溶的精确分类学和功能分析成为可能.
结论:
- 改进的空气采样和NGS协议对于准确的生物气溶分析至关重要.
- 长读序列和元转录组学等技术可以检测活跃和传染性的生物气溶病原体.
- 了解生物气溶社区对于评估大气作用和人类健康风险至关重要.
