使用源相关的移动遗传元素来识别动物感染的肠外E. 大肠杆菌感染
Cindy M Liu1,2, Maliha Aziz1, Daniel E Park1
1Antibiotic Resistance Action Center, Department of Environmental and Occupational Health, Milken Institute School of Public Health, George Washington University, 800 22nd Street NW, Washington, DC 20052, USA.
One health (Amsterdam, Netherlands)
|June 26, 2023
概括
食物传播的动物性埃舍里希亚大肠杆菌 (FZEC) 导致大约8%的人类肠外感染,主要是尿路感染. 某些FZEC菌株具有很高的毒性潜力,这突显了需要"一个健康"战略来减少传播.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 流行病学 流行病学
背景情况:
- 大肠杆菌 (E. coli) 是人类感染的常见原因,从动物传播给人类是一个重大问题.
- 食品传播动物性大肠杆菌 (FZEC) 对人类疾病负担的具体贡献及其特征尚未确定.
- 一个健康的方法对于了解动物和人类群体之间的病原体传播至关重要.
研究的目的:
- 量化由FZEC引起的人类肠外大肠杆菌感染的比例.
- 识别FZEC菌株的显著基因组特征和毒性潜力.
- 开发一种用于预测大肠杆菌起源的新型模型,并为公共卫生干预提供信息.
主要方法:
- 对3,111个临床和肉来源大肠杆菌分离物的比较基因组分析.
- 鉴定了17个与源相关的移动遗传元素 (等离子体,细菌菌体).
- 开发和应用贝叶斯隐藏类模型来预测孤立起源.
主要成果:
- 在研究群体中,大约8%的人体肠外大肠杆菌感染归因于FZEC.
- FZEC菌株表现出与非FZEC菌株相似的致病潜力.
- 两个FZEC系 (ST131-H22和ST58) 呈现出特别高的毒性潜力.
- 总的来说,FZEC会导致更多的尿路感染,而不是单独的非大肠杆菌泌尿病原体物种.
结论:
- FZEC对人类肠外大肠杆菌疾病负担,特别是尿路感染有显著的贡献.
- 开发的基因组和建模方法有效地预测了大肠杆菌的来源.
- 调查结果支持实施"一个健康"战略,以减轻与FZEC相关的公共卫生风险.
