一种基于过器辅助蛋白沉 (FAPP) 的新型样本预处理方法,用于LC-MS图的生物类似性表征
Sanghati Bhattacharya1, Anurag S Rathore1
1Chemical Engineering Department, Indian Institute of Technology Delhi, India.
Journal of pharmaceutical and biomedical analysis
|June 26, 2023
概括
一种新的过辅助蛋白沉 (FAPP) 方法改善了生物类似分析的蛋白质消化. 这种技术提高了质谱中的产量和精度,这对于可比性研究至关重要.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 分析化学 分析化学
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
背景情况:
- 生物类似的开发依赖于分析和功能上的可比性.
- 通过LC-MS进行片映射是序列相似性和PTM分析的关键.
- 传统的自下而上的蛋白质样本准备在蛋白质消化和提取方面面临挑战.
研究的目的:
- 开发一种简化的酶性消化技术,以改善蛋白质样本的制备.
- 为了最大限度地减少蛋白质提取和消化中使用的化学物质的干扰.
- 为了提高的产量和减少基于质谱的分析中的工件.
主要方法:
- 加入分子量过器和蛋白质沉.
- 一夜间的酶性消化以最大限度地减少变质,减少和化剂的干扰.
- 波器辅助蛋白沉 (FAPP) 方法的开发.
主要成果:
- FAPP方法显著减少了对清洁的需求.
- 实现了更高的产量,鉴定出了30%更多的.
- 证明了消化效率的提高:8.19%更多的完全消化的,14%更高的序列覆盖率,11.82%更多的特定部位的变化.
- 展示了FAPP协议的定量和质量的可重复性.
结论:
- 拟议的FAPP协议为传统的蛋白质样本制备方法提供了有效的替代方案.
- FAPP提高了用于生物类似分析的片映射的效率和准确性.
- 这种方法为LC-MS应用提供了更高的产量和更好的数据质量.
