卡斯特春季微生物群:多样性,核心种群和社区对病原体和抗生素耐药性基因污染的反应
Edina Szekeres1, Andreea Baricz2, Adorján Cristea3
1Department of Molecular Biology and Biotechnology, Faculty of Biology and Geology, Babeș-Bolyai University, Cluj-Napoca, Romania; Centre for Systems Biology, Biodiversity and Bioresources, Babeș-Bolyai University, Cluj-Napoca, Romania; National Institute of Research and Development for Biological Sciences, Institute of Biological Research, Cluj-Napoca, Romania.
石泉有稳定的核心微生物群,但超过一半被便细菌和抗生素耐药基因污染. 像Synergistota这样的特定细菌群可以监测这些重要的水资源中的污染.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 环境科学 环境科学
- 水资源管理 水资源管理
背景情况:
- 石灰岩含水层是全球饮用水的重要来源.
- 它们的高透性使得它们容易受到污染.
- 关于岩泉微生物组和污染影响的详细知识是有限的.
研究的目的:
- 为了描述岩石泉的稳定核心微生物群.
- 调查抗生素耐药性基因 (ARG) 和移动遗传元素 (MGE) 的存在和传播.
- 评估一个结合的方法,用于评估微生物污染物在石环境.
主要方法:
- 在罗马尼亚的一年内,季节性地采样了八个石灰岩泉.
- 用于微生物社区分析的16S rRNA基因扩增序列测序.
- 使用SmartChipTM进行高通量抗生素耐药性基因定量和在Compact DryTM板上培养病原体.
主要成果:
- 确定了一个由Pseudomonadota,Bacteroidota和Actinomycetota主导的稳定的核心细菌群落.
- 居住在淡水中的Rhodoferax,Flavobacterium和Pseudomonas属形成了核心微生物群.
- 超过50%的泉源显示出便污染,高水平的ARG (硫胺,化物,三甲) 与转移酶和插入序列有关.
- 确定了Synergistota,Mycoplasmatota和Chlamydiota作为潜在的污染指标.
结论:
- 卡斯特泉源拥有弹性核心微生物群,但经常受到污染.
- 结合测序,培养和ARG量化方法是有效的评估微生物污染物在低生物质环境.
- 特定的细菌类可以作为监测石泉污染的指标.
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