通过计算设计和合成图书馆查获得的广泛沙尔贝科病毒中和抗体
Xuehua Yang1, Huarui Duan1, Xiuying Liu1
1NHC Key Laboratory of Systems Biology of Pathogens, Institute of Pathogen Biology, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Beijing, China.
Journal of virology
|June 27, 2023
概括
研究人员通过计算设计并确定了包括AI-1028在内的新型抗体,这些抗体可以中和广泛的sarbecoviruses,如SARS-CoV-2变种和相关的蝙蝠病毒. 这些发现为新出现的冠状病毒威胁提供了潜在的新疗法.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 药物发现 药物发现 药物发现
背景情况:
- 包括SARS-CoV和SARS-CoV-2在内的Sarbecovirus亚属,由于病毒的快速演变和免疫逃避,对人类健康构成重大威胁.
- 现有的中和抗体药物面临着针对SARS-CoV-2变种和潜在的动物传染性溢出事件的挑战.
- 广泛中和抗体对于对抗各种沙贝科病毒的流行病准备至关重要.
研究的目的:
- 通过计算设计和优化抗体,增强中和活性和更广泛的对抗sarbecoviruses.
- 从合成图书馆中识别具有广泛中和活动的新型纳米体.
- 提供潜在的泛沙尔贝病毒中和药物,并为治疗候选药物开发快速优化途径.
主要方法:
- 来自代表性sarbecoviruses的保存受体结合域 (RBDs) 的结构分析.
- 计算设计和分子动力学模拟以增强抗体-RBD相互作用.
- 针对多个SARS-CoV-2变种和其他sarbecoviruses的设计抗体的净化和评估.
- 用RBD作为诱对化学合成的纳米体库进行选.
主要成果:
- 计算设计产生了优化的抗体,AI-1028显示出对SARS-CoV,SARS-CoV-2变种和蝙蝠衍生病毒的强大中和.
- 设计的抗体表现出增加的中和活性,从几到数百倍,由于增强的分子间相互作用.
- 从合成图书馆中确定了两种具有广泛中和活动的新型纳米体.
- AI-1028识别了与其父母抗体相同的神秘RBD表位,表明保存的目标识别.
结论:
- 基于结构的计算设计和纳米体库选是开发广谱中和抗体的有效策略.
- 开发的抗体,包括AI-1028,代表了对当前和未来的萨尔贝科病毒威胁有前途的治疗候选者.
- 这些方法为快速开发抗体治疗新兴,高度可变的病原体提供了指导.
