非目标植物代谢学:评估冷化作为样品制备技术
Christina Maisl1, Maria Doppler1,2, Bernhard Seidl1
1Department of Agrobiotechnology IFA-Tulln, Institute of Bioanalytics and Agro-Metabolomics, University of Natural Resources and Life Sciences, Vienna, Konrad-Lorenz-Str. 20, 3430 Tulln, Austria.
Metabolites
|June 27, 2023
概括
软化,一种稳定生物样本的方法,显著改变小麦根的代谢组成,影响代谢物检测和丰度. 虽然提取物度会导致较小的代谢物损失,但样品稳定会影响整体代谢概况.
科学领域:
- 代谢学 代谢学 代谢学
- 植物科学 植物科学
- 分析化学 分析化学
背景情况:
- 热化广泛用于生物样品稳定和提取物度.
- 在冷凍化過程中代謝組成和代謝物損失的潛在變化尚未完全理解.
- 小麦根作为一个模型系统来评估冷化对植物代谢学的影响.
研究的目的:
- 为了研究冷凍化對小麥根樣本代謝組成的影響.
- 通过冷化来评估提取物度期间的代谢物回收和潜在损失.
- 为了确定特定的代谢物类是否不成比例地受到冷化的影响.
主要方法:
- 使用RP-LC-HRMS分析新鲜和冷的小麦根样本 (原生和13C标记).
- 用不同稀释因子 (高达32) 进行稀释提取物的研究.
- 在新鲜样品和冷样品之间以及不同度的代谢物概况的比较.
主要成果:
- 解热化改变了代谢样本的组成,其中7%的代谢物丢失,高达43%的代谢物呈现出改变的丰度.
- 在提取物度过程中,预期的代谢物完全丢失的不到5%.
- 随着度因子的增加,回收率略有下降,平均在32倍缩时达到85%.
结论:
- 软化显著影响小麦根代谢特征,影响代谢物存在和丰度.
- 虽然通过冷化取物度导致较小的代谢物损失,但样品稳定对代谢完整性构成更大的挑战.
- 没有特定的小麦代谢物类别被确定为受解冷过程的独特影响.
