对犬类软组织肉瘤的综合分析确定了TP53,KMT基因和PDGFB融合中的反复突变
Sunetra Das1,2, Rupa Idate1,2, Susan E Lana1,2
1Department of Clinical Sciences, College of Veterinary Medicine and Biomedical Sciences, Colorado State University, Fort Collins, CO, 80523, USA.
Scientific reports
|June 27, 2023
概括
狗软组织肉瘤 (STS) 的基因组分析揭示了细胞周期和染色质组织基因的常见突变. 这项多学科研究确定了潜在的治疗点,为狗和人类推进精确的癌症治疗.
科学领域:
- 比较性瘤学研究
- 基因组学和转录基因组学
- 癌症生物学 癌症生物学
背景情况:
- 软组织肉瘤 (STS) 是多样化的介质细胞瘤,在狗和人类中具有有限的向治疗.
- 精确的癌症医学需要了解自然存在的犬类STS中的分子驱动因素.
- 目前局部瘤的现有治疗方法包括手术和辐射,只有很少的分子向选择.
研究的目的:
- 描述犬类STS亚型的转录组和基因组突变特征.
- 确定犬类STS中的分子驱动因素和潜在的治疗点.
- 为了更好的诊断和治疗,将犬类STS的分子概况与人类对应物进行比较.
主要方法:
- 使用RNA测序 (RNAseq) 和整个外基因组测序.
- 使用了免疫组织化学和药物分析.
- 对纤维肉瘤,未分化的多形肉瘤和外围神经膜瘤进行了多组数据集成.
主要成果:
- 在细胞周期/DNA修复 (31%) 和染色体组织/结合 (41%) 基因中发现了常见的驱动突变.
- 发现了融合转录 (PDGFB-原),预测了对PDGFR抑制剂的敏感性.
- 转录基因分析显示了4种不同的犬类STS集群,具有特定的分子丰富,包括T细胞透.
结论:
- 这种多omics方法提供了对犬类STS亚型的分子洞察力.
- 已识别的分子变化为化疗和免疫治疗提供了潜在的点.
- 这些发现有助于与人类肉瘤进行比较,有助于为这两种物种开发精确的癌症治疗方法.


