扩展PCR小组测试用于识别类似流感的疾病中的呼吸道病原体和共感染
Pallavi Upadhyay1, Jairus Reddy1, Teddie Proctor2
1HealthTrackRx R&D Division, Denton, TX 76207, USA.
Diagnostics (Basel, Switzerland)
|June 28, 2023
概括
共同感染在呼吸道感染中很常见,超过一半的症状患者携带多种病原体. 多重PCR测试有效地识别这些共感染,有助于患者管理和抗菌药物管理.
科学领域:
- 临床微生物学 临床微生物学
- 传染性疾病 传染性疾病
- 分子诊断学 分子诊断学
背景情况:
- 类似流感的疾病 (ILI) 通常是由SARS-CoV-2以外的其他病原体引起的.
- 与多种病原体的同时感染在患有ILI的患者中很常见.
研究的目的:
- 识别在症状患者中引起ILI的各种生物.
- 评估两个多重实时PCR平台用于病原体检测和共感染分析.
主要方法:
- 收集了381名具有ILI症状的患者的鼻腔和鼻口腔抽样.
- 使用两个PCR平台测试的样品:应用生物系统TMTrueMarkTM呼吸系统面板2.0OpenArrayTM板 (32个目标) 和TaqManTM阵列卡 (41个目标).
- 分析了平台一致性的结果,并确定了共感染.
主要成果:
- 观察到两家PCR平台之间的高度一致性.
- 大约58%的样本检测到至少一个病原体.
- 共感染是普遍存在的 (约36-40%的阳性样本),其中细菌-病毒共感染是最常见的 (约69%).
- 发现的关键病原体包括*S. aureus* (~30%),SARS-CoV-2 (~25%),犀利病毒 (~15%),以及HHV6 (~10%).
结论:
- 共感染是呼吸道感染 (RTIs) 的重要因素.
- 基于综合征面板的多重PCR测试对于识别共感染病原体非常有价值.
- 准确的病原体识别可以改善患者管理,临床结果和抗菌药物管理.
