作为二次调节区域的Meg8-DMR调节了微RNA的表达,但不会影响小鼠的胚胎发育
Liang Zhang1, Zhengbin Han1, Hongjuan He1
1School of Life Science and Technology, Harbin Institute of Technology, Harbin 150001, China.
Genes
|June 28, 2023
概括
在小鼠中,Meg8-DMR根据父母遗传的不同,对微RNA的表达有不同的调节. 这种印记区域会影响胚胎发育途径,但不会改变整体印记状态.
科学领域:
- 遗传学 遗传学 是一个
- 发展生物学 发展生物学
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
背景情况:
- 梅格8-DMR是第一个在印记Dlk1-Dio3域中识别的母体甲基化差异甲基化区域 (DMR).
- 以前的研究表明,Meg8-DMR删除会影响细胞迁移和入侵,但其在小鼠发育中的作用尚不清楚.
研究的目的:
- 在小鼠发育过程中调查Meg8-DMR的生物功能.
- 确定Meg8-DMR删除对微RNA表达和下游发育途径的影响.
主要方法:
- 在小鼠中使用CRISPR/Cas9.9生成Meg8-DMR基因组删除.
- 利用高通量和生物信息学分析分析微RNA表达.
- 在基因和基因组的京都百科全书 (KEGG) 途径和基因本体学 (GO) 术语上对差异表达基因 (DEG) 进行了丰富分析.
主要成果:
- 继承于父 (Pat-KO) 或 homozygously (Homo-KO) 的Meg8-DMR删除上调了microRNA表达,而母性遗传 (Mat-KO) 并没有改变表达.
- 分别在Pat-KO,Mat-KO和Homo-KO组中确定了502个,128个和165个DEG.
- 对GO的分析显示,对Pat-KO/Homo-KO的轴突发生和对Mat-KO的前脑发育的丰富,对关键基因的甲基化水平或印记状态没有影响.
结论:
- 8-DMR作为一个控制微RNA表达的二次调节区域.
- 删除Meg8-DMR对microRNA表达的影响取决于源代基因.
- Meg8-DMR对于调节特定的发育途径至关重要,特别是轴突发生和前脑发育,而不会破坏正常的胚胎发育.
