在肝细胞癌中创建一个使用cuproptosis相关的长非编码RNA的预后模型
Lihong Yang1, Xiao Jia1, Yueyue Fu1
1State Key Laboratory of Medicinal Chemical Biology, College of Pharmacy and Tianjin Key Laboratory of Molecular Drug Research, Nankai University, Tianjin 300000, China.
International journal of molecular sciences
|June 28, 2023
概括
细胞亡,一种与肝癌 (HCC) 相关的细胞死亡,涉及长非编码RNA (lncRNAs). 研究人员开发了一个lncRNA风险模型来预测HCC的预后,确定PCAT6作为潜在的生物标志物.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 分子生物学分子生物学
- 在瘤学瘤学.
背景情况:
- 质亡是一种由铜诱导的细胞死亡机制,与肝细胞癌 (HCC) 有关.
- 长非编码RNAs (lncRNAs) 被认为是各种癌症的潜在预后生物标志物.
- 在HCC中lncRNAs在cuproptosis中的特定作用仍然在很大程度上未被探索.
研究的目的:
- 建立基于lncRNA风险的预后模型,用于预测HCC的结果.
- 在HCC中识别与cuproptosis相关的新型lncRNAs.
- 为了研究特定的lncRNAs,如PCAT6在HCC进展中的功能作用.
主要方法:
- 使用皮尔森相关性识别cuproptosis共同表达的lncRNAs.
- 开发使用考克斯,拉索和多变量考克斯回归分析的预后风险模型.
- 使用Kaplan-Meier生存分析,主要组件分析,ROC曲线和名ogram构造进行验证. PCAT6的功能验证涉及RT-PCR和淘汰实验.
主要成果:
- 七个lncRNA被确定为HCC的独立预后因素.
- 开发的lncRNA风险模型证明了患者预后的独立预测能力.
- 发现前列腺癌相关的转录6 (PCAT6) 在HCC细胞系中表达高,其敲击减少了细胞的增殖和迁移.
结论:
- 一个基于lncRNA的新型风险模型可以有效预测肝细胞癌的预后.
- PCAT6在HCC中显著上调,并在瘤进展中发挥作用,表明其作为预后生物标志物的潜力.
