皮肤黑色素瘤中循环基因的干扰 - - 转录基因数据库的分析
Monika Lesicka1, Bogusław Nedoszytko2,3, Edyta Reszka1
1Department of Translational Research, Nofer Institute of Occupational Medicine, 91-349 Lodz, Poland.
International journal of molecular sciences
|June 28, 2023
概括
皮肤皮肤黑色素瘤 (SKCM) 的改变昼夜基因表达与较差的生存率有关. 这些基因还与免疫细胞透相关,为黑色素瘤患者提供潜在的预后标志物.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 遗传学 遗传学 是一个
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 循环基因调节基本的生理过程,包括新陈代谢和免疫功能.
- 皮肤皮肤黑色素瘤 (SKCM) 是一种具有显著死亡率的侵袭性皮肤癌形式.
- 了解昼夜节律和黑色素瘤进展之间的相互作用对于改善患者的治疗结果至关重要.
研究的目的:
- 为了研究SKCM中24个昼夜基因的表达模式.
- 评估SKCM患者昼夜基因变异的预后价值.
- 探索昼夜基因表达和SKCM中的免疫细胞透水平之间的关系.
主要方法:
- 在使用GEPIA,TIMER 2.0和cBioPortal数据库进行形分析.
- 在SKCM中评估24个昼夜基因的转录水平和预后意义.
- 昼夜基因表达和免疫透标志物之间的相关性分析.
主要成果:
- 与正常皮肤相比,超过一半的研究的昼夜基因在SKCM中表现出改变的表达.
- 特定的昼夜基因如TIMELESS和BHLHE41被上调,而包括BMAL1和PER1在内的其他基因被下调.
- 患有昼夜基因变异的SKCM患者的整体存活率下降,昼夜基因与免疫细胞透,特别是中性粒细胞之间的相关性显著.
结论:
- 循环基因失调是SKCM的重要特征,与患者存活率降低有关.
- 昼夜基因与免疫细胞透之间的强烈相关性表明,昼夜调节在瘤微环境中的作用.
- 这些发现突出了昼夜基因作为潜在的预后和预测生物标志物,用于指导个性化的黑色素瘤治疗策略.


