对抗多种药物抗性 Pseudomonas aeruginosa 序列235型的比较基因组分析 从苏丹分离出来
Mohamed A Hussain1, Malik Suliman Mohamed2,3, Hisham N Altayb4
1Department of Pharmaceutical Microbiology, Faculty of Pharmacy, International University of Africa, Khartoum P.O. Box 2469, Sudan.
Microorganisms
|June 28, 2023
概括
Pseudomonas aeruginosa 呈现出高抗生素耐药性,其中 18% 的分离物体表现出多药耐药性 (MDR). 全基因组测序揭示了菌株特异性基因和最耐药菌株的新型GyrA突变,突出显示了对感染控制的需求.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 传染性疾病 传染性疾病
背景情况:
- Pseudomonas aeruginosa 是一个重要的机会性病原体,以其对广泛抗生素的内在和获得性耐药性而闻名.
- 多药耐药 (MDR) P. aeruginosa对公共健康构成严重威胁,复杂化治疗选择并增加患者死亡率.
研究的目的:
- 在Pseudomonas aeruginosa的临床分离物中研究极端抗生素耐药性的基因组基础.
- 将高度耐药菌株的基因组与敏感菌株进行比较,以确定与耐药性相关的遗传元素.
主要方法:
- 一项涉及200个临床P. aeruginosa分离物的横截面研究.
- 全基因组测序,组装和注释最耐药的隔离物.
- 在MDR菌株和两种敏感菌株之间进行比较基因组分析.
主要成果:
- 对皮佩拉西林 (77.89%), جنت米辛 (25.13%),西普洛素 (21.61%),塞夫塔齐迪姆 (18.09%),梅罗 (5.53%) 和聚米辛B (4.52%) 观察到高耐药率.
- 18% (36/200) 的分离物表现出一种MDR表型,其中最耐药的菌株属于ST-235.
- 这种MDR基因组包含了特定菌株的辅助基因,一种传导体,一种等离子体,67个抗性基因 (包括48个排泄),以及一种新的有害的GyrA突变 (D87G),但缺乏特定的抗伪抗性抗性基因或抗性岛屿.
结论:
- 基因组分析确定了特定于菌株的辅助基因和一种新的 gyrA 突变,该突变有助于P. aeruginosa的MDR表型.
- 尽管缺乏针对特定抗伪药的已知耐药基因,但MDR菌株含有众多耐药基因,包括排泄,以及 gyrA.中的关键突变.
- 这些发现强调了实施强有力的感染控制策略的重要性,以防止MDR P. aeruginosa的传播.
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