基于线粒体遗传学的老鼠肺的全球传播模式
Xia Tian1,2,3,4,5, Shen Chen1,2,3,4,5, Lei Duan1,2,3,4,5
1National Institute of Parasitic Diseases, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Shanghai 200025, China.
Pathogens (Basel, Switzerland)
|June 28, 2023
概括
在全球范围内,老鼠肺 (Angiostrongylus cantonensis) 导致异性脑膜炎. 遗传分析表明,它的传播起源于东南亚,而Clade II在该地区之外占主导地位.
科学领域:
- 寄生虫学的寄生虫学
- 基因组学就是基因组学.
- 流行病学 流行病学
背景情况:
- 由Angiostrongylus cantonensis引起的异性脑膜炎是一个日益严重的全球健康问题.
- 对于A. cantonensis感染的新流行地区包括南美和西班牙.
- 越来越多的遗传数据提供了对寄生虫在全球传播的见解.
研究的目的:
- 使用遗传数据分析Angiostrongylus cantonensis的全球传播模式.
- 为了表征A. cantonensis的基因类型和族系.
- 为了调查A. cantonensis类的起源和分布.
主要方法:
- 测序了A. cantonensis的八个额外的线粒体 (mt) 基因组.
- 使用贝叶斯推断和网络分析对554万亿个基因组/片段 (1472个标本) 的基因组分析.
- 通过映射mt基因片段来完成mt基因组的基因类型的表征.
主要成果:
- 遗传学和网络分析确定了基于cox1和cytb基因的六个主要类 (I-VI) 和额外的类 (I2,II2,III2,V2,VII,VIII).
- 与其他地区相比,A. cantonensis的哈普洛型多样性在东南亚和东亚显著更高.
- 在东南/东亚以外的大多数样本 (78/81) 属于Clade II,新世界多样性高于太平洋.
结论:
- 遗传数据表明,安吉斯特朗吉卢斯 (Angiostrongylus cantonensis) 是从东南亚引入的.
- 克莱德二是东南亚以外地区的主流血统,特别多样化在新世界.
- 建议进行进一步的全球研究,以充分了解大鼠肺的传播动态.
